ARGOMENTO:

jnthnlvnstn ha scritto:

Questo perché non si leggerà mai che la cura per l'hiv o il cancro l'ha scoperta boinc ma soltanto perché fra i miliardi di combinazioni fra proteine noi abbiamo eliminato il 30% di quelle non funzionanti, non poco.
Solo la mappatura del genoma umano significa che nessun ricercatore deve spendere una vita intera solo per arrivare ad una conclusione sbagliata, sprecandola, quello che sappiamo oggi, ieri costava anni di elaborazione grazie a noi il dato è bello che pronto senza perderci altro tempo.
L'aiuto che diamo è concreto, non sono soldi che magari finiscono in forniture di guanti in lattice per fare un favore all'amico imprenditore...

Innanzitutto ciao, vorrei darti pure io il benvenuto sul forum!

Quanto al tuo intervento, soprattutto quello che ho sottolineato, vorrei dire che ritengo siano meccanismi e dati non corretti.
Boinc ha delle potenzialità ma non ritengo funzionino affatto così le cose.
Non si testano miliardi di combinazioni fra proteine, scartando quelle non funzionanti. E Boinc io ritengo abbia un ruolo diverso.
1) Alcuni progetti simulano e cercano di comprendere il folding delle proteine. In genere su quelle piccole, con folding breve e che si conoscono già bene, per testare gli algoritmi di calcolo. Solo capendo in maniera precisa le proteine, funzionamento e folding (e ci siamo ancora lontani) si potrà cercare di crearne di nuove, per utilizzarle per scopi nostri.
2) Alcune proteine sono utilizzate come farmaci (interferone, antibiotici peptidici..) Ma per la stragrande maggioranza dei casi, i farmaci non sono affatto proteine.
In futuro, enzimi e proteine potranno avere maggior spazio di cura (per la terapia genica, ad esempio). Ma come ho detto prima, non siamo ancora in grado di crearne di specifiche (non si tratta di trovarle tra quelle già esistenti a nostra disposizione).
3) Prendiamo FAAH su WCG. Progetto 29, quello attualmente distribuito.
Le proteine virali (HIV proteasi) prese in esame sono solamente 6. Il software simula l'interazione sui siti attivi di queste proteine una quantità enorme di molecole, che sono i farmaci candidati. Si cercano dei nuovi antivirali specifici, in pratica.
Rosetta, invece, sull'HIV ha un approccio diverso e ben più ambizioso: creare delle proteine che interagiscano col sistema immunitario umano per consentirgli il riconoscimento e la produzione di anticorpi per particolari siti attivi specifici nelle proteine di rivestimento del virus. Un approccio innovativo che, secondo me, ha meno possibilità di dare dei risultati concreti, rispetto FAAH. Almeno per ora.

Sono questioni complesse. Da studente in medicina, pure a me risulta difficile comprendere nei particolari cosa ci diano da scaccolare..

Rieccomi, come dici Heric Boinc ha delle potenzialità ma è solo un applicativo, un'interfaccia non il progetto o la ricerca, da come parli pare tu ti riferisca alle wu relative al testing, li si testano algoritmi e metodi per il calcolo, nelle wu invece relative ai singoli progetti si testano interazioni fraa proteine e altre sostanze che sono caandidate a diventare farmaci o parte di essi, nel caso specifico di fightaids spesso si testano gli "agganci" (chiamiamoli cosi) che alcune proteine riescono o meno ad effettuare con le "code" (chiamiamole ancora cosi) che alcune molecole candidate lasciano libere dopo essere state modificate.
Come dicevi prima è complicato e giuro di conoscere bene il meccanismo ma il forum non è di medicinaa e occorre spendere poche parole maa buone che risultino comprensibili a tutti, mi spiace che nel post precedente la parte relativa ai ricercatori sia risultata pasticciata per via del pochissimo tempo che ho per scrivere, in quella parte dicevo che sarei pure contento di sapere che ricercatori spreconi facciano prove che magari non servono a molto ma sai... nel dubbio, ma si! Diamo sta cosa in pasto agli scaccolatori.
I progressi fatti nel campo della ricerca pura sono stati pubblicati, compresi i dubbi su quali siano gli algoritmi migliori per simulare l'interazione fra farmaci e proteine (perché di simulazione si tratta) per poi testare dal vero e in laboratorio le "candidate" migliori, si lavora sugli algoritmi e noi lavoriamo sui progetti sfruttando il migliore di questi, in definitivaa c'è chi fa ricerca nella ricerca e mettere insieme informatici e medici non dev'essere proprio facilissimo.
Riguardo a Gentoo invece d'accordissimo che unaa Gentoo da stage 1 o 3 sia da preferire senz'altro a sabayon devo spezzare una lancia in favore di sabayon che consente di installare un minimo sistema operativo e poi riemergere il tutto con le use-flag personalizzate, chiaro che pure con ubuntu o kubuntu si può compilare ma se tutto il sistema operativo è compilato funziona meglio e più velocemente.
Per esempio io uso da quando è uscita la versione 6.4.5 di boinc cosi come uso firefox 3.5.1 da quando è uscita perché compilata etc. etc.
Purtroppo non ho moltissimo tempo lavoro tanto e di notte ma cercherò di seguire la discussione che mi appassiona.
Ciao a tutti di nuovo.

da quasi una settimana questo progetto non và (peccato, ci tengo proprio a lui)...
stessi messaggi di boinc manager ogni qualvolta lo contatta:

dom 23 ago 2009 08:57:23 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Sending scheduler request: To fetch work.
dom 23 ago 2009 08:57:23 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Requesting new tasks
dom 23 ago 2009 08:57:24 CEST Project communication failed: attempting access to reference site
dom 23 ago 2009 08:57:25 CEST Internet access OK - project servers may be temporarily down.
dom 23 ago 2009 08:57:28 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Scheduler request failed: Problem with the SSL CA cert (path? access rights?)
dom 23 ago 2009 08:58:30 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Fetching scheduler list
dom 23 ago 2009 08:58:35 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Master file download succeeded
dom 23 ago 2009 08:58:40 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Sending scheduler request: To fetch work.
dom 23 ago 2009 08:58:40 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Requesting new tasks
dom 23 ago 2009 08:58:41 CEST Project communication failed: attempting access to reference site
dom 23 ago 2009 08:58:42 CEST Internet access OK - project servers may be temporarily down.
dom 23 ago 2009 08:58:45 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Scheduler request failed: Problem with the SSL CA cert (path? access rights?)
dom 23 ago 2009 08:59:46 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Sending scheduler request: To fetch work.
dom 23 ago 2009 08:59:46 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Requesting new tasks
dom 23 ago 2009 08:59:47 CEST Project communication failed: attempting access to reference site
dom 23 ago 2009 08:59:51 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Scheduler request failed: Problem with the SSL CA cert (path? access rights?)
dom 23 ago 2009 08:59:53 CEST Internet access OK - project servers may be temporarily down.
dom 23 ago 2009 09:00:51 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Sending scheduler request: To fetch work.
dom 23 ago 2009 09:00:51 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Requesting new tasks
dom 23 ago 2009 09:00:52 CEST Project communication failed: attempting access to reference site
dom 23 ago 2009 09:00:53 CEST Internet access OK - project servers may be temporarily down.
dom 23 ago 2009 09:00:56 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Scheduler request failed: Problem with the SSL CA cert (path? access rights?)
dom 23 ago 2009 09:01:57 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Sending scheduler request: To fetch work.
dom 23 ago 2009 09:01:57 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Requesting new tasks
dom 23 ago 2009 09:01:58 CEST Project communication failed: attempting access to reference site
dom 23 ago 2009 09:01:59 CEST Internet access OK - project servers may be temporarily down.
dom 23 ago 2009 09:02:02 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Scheduler request failed: Problem with the SSL CA cert (path? access rights?)
dom 23 ago 2009 09:03:02 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Sending scheduler request: To fetch work.
dom 23 ago 2009 09:03:02 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Requesting new tasks
dom 23 ago 2009 09:03:03 CEST Project communication failed: attempting access to reference site
dom 23 ago 2009 09:03:04 CEST Internet access OK - project servers may be temporarily down.
dom 23 ago 2009 09:03:07 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Scheduler request failed: Problem with the SSL CA cert (path? access rights?)
dom 23 ago 2009 09:05:28 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Sending scheduler request: To fetch work.
dom 23 ago 2009 09:05:28 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Requesting new tasks
dom 23 ago 2009 09:05:29 CEST Project communication failed: attempting access to reference site
dom 23 ago 2009 09:05:31 CEST Internet access OK - project servers may be temporarily down.
dom 23 ago 2009 09:05:33 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Scheduler request failed: Problem with the SSL CA cert (path? access rights?)
dom 23 ago 2009 09:12:10 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Sending scheduler request: To fetch work.
dom 23 ago 2009 09:12:10 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Requesting new tasks
dom 23 ago 2009 09:12:11 CEST Project communication failed: attempting access to reference site
dom 23 ago 2009 09:12:12 CEST Internet access OK - project servers may be temporarily down.
dom 23 ago 2009 09:12:15 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Scheduler request failed: Problem with the SSL CA cert (path? access rights?)
dom 23 ago 2009 09:16:46 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Sending scheduler request: To fetch work.
dom 23 ago 2009 09:16:46 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Requesting new tasks
dom 23 ago 2009 09:18:46 CEST Project communication failed: attempting access to reference site
dom 23 ago 2009 09:18:46 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Scheduler request failed: Timeout was reached
dom 23 ago 2009 09:18:48 CEST Internet access OK - project servers may be temporarily down.
dom 23 ago 2009 09:55:10 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Sending scheduler request: To fetch work.
dom 23 ago 2009 09:55:10 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Requesting new tasks
dom 23 ago 2009 09:55:11 CEST Project communication failed: attempting access to reference site
dom 23 ago 2009 09:55:12 CEST Internet access OK - project servers may be temporarily down.
dom 23 ago 2009 09:55:13 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Scheduler request failed: Problem with the SSL CA cert (path? access rights?)
dom 23 ago 2009 11:30:45 CEST www.worldcommunitygrid.org/ update requested by user
dom 23 ago 2009 11:30:52 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Sending scheduler request: Requested by user.
dom 23 ago 2009 11:30:52 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Requesting new tasks
dom 23 ago 2009 11:30:53 CEST Project communication failed: attempting access to reference site
dom 23 ago 2009 11:30:55 CEST Internet access OK - project servers may be temporarily down.
dom 23 ago 2009 11:30:57 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Scheduler request failed: Problem with the SSL CA cert (path? access rights?)
dom 23 ago 2009 11:31:03 CEST Contacting account manager at bam.boincstats.com/
dom 23 ago 2009 11:31:04 CEST Account manager: BAM! User-ID: 64928
dom 23 ago 2009 11:31:04 CEST Account manager: BAM! Host-ID: 180958
dom 23 ago 2009 11:31:04 CEST Account manager: This host connected 7 times to BAM!
dom 23 ago 2009 11:31:04 CEST Account manager contact succeeded
dom 23 ago 2009 11:42:36 CEST Contacting account manager at bam.boincstats.com/
dom 23 ago 2009 11:42:38 CEST Account manager: BAM! User-ID: 64928
dom 23 ago 2009 11:42:38 CEST Account manager: BAM! Host-ID: 180958
dom 23 ago 2009 11:42:38 CEST Account manager: This host connected 8 times to BAM!
dom 23 ago 2009 11:42:38 CEST Account manager contact succeeded
dom 23 ago 2009 11:42:38 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Resetting project
dom 23 ago 2009 11:42:38 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Detaching from project
dom 23 ago 2009 11:44:27 CEST Contacting account manager at bam.boincstats.com/
dom 23 ago 2009 11:44:29 CEST Account manager: BAM! User-ID: 64928
dom 23 ago 2009 11:44:29 CEST Account manager: BAM! Host-ID: 180958
dom 23 ago 2009 11:44:29 CEST Account manager: This host connected 9 times to BAM!
dom 23 ago 2009 11:44:29 CEST Account manager contact succeeded
dom 23 ago 2009 11:44:29 CEST Attaching to www.worldcommunitygrid.org/
dom 23 ago 2009 11:44:48 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Master file download succeeded
dom 23 ago 2009 11:44:53 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Sending scheduler request: Project initialization.
dom 23 ago 2009 11:44:53 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Requesting new tasks
dom 23 ago 2009 11:44:54 CEST Project communication failed: attempting access to reference site
dom 23 ago 2009 11:44:56 CEST Internet access OK - project servers may be temporarily down.
dom 23 ago 2009 11:44:58 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Scheduler request failed: Problem with the SSL CA cert (path? access rights?)
dom 23 ago 2009 11:45:59 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Sending scheduler request: Project initialization.
dom 23 ago 2009 11:45:59 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Requesting new tasks
dom 23 ago 2009 11:46:00 CEST Project communication failed: attempting access to reference site
dom 23 ago 2009 11:46:01 CEST Internet access OK - project servers may be temporarily down.
dom 23 ago 2009 11:46:04 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Scheduler request failed: Problem with the SSL CA cert (path? access rights?)
dom 23 ago 2009 11:47:04 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Sending scheduler request: Project initialization.
dom 23 ago 2009 11:47:04 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Requesting new tasks
dom 23 ago 2009 11:47:05 CEST Project communication failed: attempting access to reference site
dom 23 ago 2009 11:47:07 CEST Internet access OK - project servers may be temporarily down.
dom 23 ago 2009 11:47:09 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Scheduler request failed: Problem with the SSL CA cert (path? access rights?)
dom 23 ago 2009 11:48:10 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Sending scheduler request: Project initialization.
dom 23 ago 2009 11:48:10 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Requesting new tasks
dom 23 ago 2009 11:48:11 CEST Project communication failed: attempting access to reference site
dom 23 ago 2009 11:48:14 CEST Internet access OK - project servers may be temporarily down.
dom 23 ago 2009 11:48:15 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Scheduler request failed: Problem with the SSL CA cert (path? access rights?)
dom 23 ago 2009 11:49:16 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Sending scheduler request: Project initialization.
dom 23 ago 2009 11:49:16 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Requesting new tasks
dom 23 ago 2009 11:49:18 CEST Project communication failed: attempting access to reference site
dom 23 ago 2009 11:49:19 CEST Internet access OK - project servers may be temporarily down.
dom 23 ago 2009 11:49:21 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Scheduler request failed: Problem with the SSL CA cert (path? access rights?)
dom 23 ago 2009 11:51:17 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Sending scheduler request: Project initialization.
dom 23 ago 2009 11:51:17 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Requesting new tasks
dom 23 ago 2009 11:51:19 CEST Project communication failed: attempting access to reference site
dom 23 ago 2009 11:51:21 CEST Internet access OK - project servers may be temporarily down.
dom 23 ago 2009 11:51:22 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Scheduler request failed: Problem with the SSL CA cert (path? access rights?)

stamattina lo disconnesso e riconesso ma niente da fare!
qualcuno mi può dire se dipende dal mio boinc o è il progetto?
se è boinc mi potete dare una mano a risolvere?
in anticipo.

@ jnthnlvnstn: ma che razza di nickname è?

A me oggi funziona senza problemi...

anche a me funziona senza problemi.

A me non ha mai dato problemi (ultimamente)

allora deduco che è il mio boinc, come risolvere?
mi sembra strano perchè di questi problemi ultimamente me li dà solo 'sto benedetto progetto.

dom 23 ago 2009 11:30:57 CEST www.worldcommunitygrid.org/ Scheduler request failed: Problem with the SSL CA cert (path? access rights?)

Dove le file ca-bundle.crt e che è la tua versione di BOINC?

FAQ: worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=14222 e

worldcommunitygrid.org/forums/wcg/viewthread?thread=15682

Anche a me funziona bene.

lampyris ha scritto:

jnthnlvnstn ha scritto:

A chi usaa linux e soprattutto a 64 bit sento di consigliare Gentoo e le sue derivate (prima fra tutte sabayon) questo perché gentoo ha come filosofia la compilazione degli applicativi sulla propria piattaforma, ottimizzando la resa del processore e degli altri componenti, sul mio acer ferrari a 64 bit la gentoo faceva scintille, oggi con due pc non riesco a fare la metà.

Io invece mi sento di sconsigliare caldamente sabayon
Premetto che uso Gentoo da un paio di anni, gentoo è strutturata in un certo modo, per lavorare con i sorgenti. E' dannoso usarla con i binari. Infatti, sabayon si porta dietro TUTTO. Tu vuoi installare solo kde? semplice, lui ti installa kde, gnome, xfce, fluxbox, etc etc (perchè ci sono un sacco di dipendenze, loro abilitano TUTTE le useflag per chiari motivi... e ciò rende il sistema un puttanaio!), abilitandoti kde come predefinito.
E poi essendo compilato, non hai alcun vantaggio rispetto a ubuntu
Anzi, ti dirò di più. I vantaggi dovuti alla compilazione sono quasi del tutto assenti! Potrebbe migliorare in qualche singolo caso, ma dipende dal modo in cui si compila quella singola applicazione. Io uso gentoo per molti altri motivi (uno fra tutti la flessibilità e il controllo che con altre distro non ho). E' prestante perchè è flessibile e la personalizzi. Ma non perchè compili!
Fidati....
Io ottengo lo stesso RAC che avevo con Ubuntu. Quindi...

Sabayon 4.2 core cd, è come fare uno stage 3 di gentoo, ci metti quello che vuoi e parti da riga di comando scegliendo use-flag window manager etc. etc. daa quando l'hai conosciuta ha fatto passi da gigante. La consigliavo soprattutto a chi non ha molta pratica col pinguino, un saluto a tutti.

Mio secondo messagio Update per

"Discovering Dengue Drugs - Phase 1 – DONE" !

All Phase 1 results that you have generated are now on our disk servers where they are being compiled, processed and double-checked. Thank for your efforts and help!

Phase 1 is only the first step on our path to discovering dengue (and West Nile, hepatitis C, yellow fever, and Leishmania) drugs. Phase 1 has systematically tested ~3 million small "drug-like" molecules against 18 different protein targets (12 viral protease targets, 6 Leishmania enzymes). These 54 million individual docking experiments were completed in less than 2 years, even with the devastating interruptions and slowdowns wrought by Hurricane Ike. Our 30-node high-performance cluster would have needed to run nonstop for 205 years to finish these calculations.

Phase 1 identified several thousand molecules that could interact with each target protein. Typically, ~90-95% of Phase 1 “hits” turn out to be false positives when tested in the laboratory. Thus, Phase 1 hits are very inefficient to pursue with laboratory testing.

"Discovering Dengue Drugs - Phase 2" is designed to reduce the number of Phase 1 false positives. In Phase 2, we will complete ~2000 computationally demanding free energy calculations for each protein target (each calculation uses a promising Phase 1 hit). These calculations will eliminate many of the Phase 1 false positives and produce refined hit lists that are expected to contain ~80% true positives. Testing Phase 2 hits in the laboratory will be much more productive, efficient, and rewarding than testing Phase 1 hits. For example, to find 25 small molecules that stop dengue virus replication in the laboratory, we would need to synthesis and test either 250-500 Phase 1 hits or ~30 Phase 2 hits. We like the improved odds provided by the Phase 2 calculations.

Alpha testing has begun for "Discovering Dengue Drugs – Phase 2". This work is moving along remarkably smoothly (special thanks to the IBM team of professionals). Beta testing and Phase 2 will launch very very shortly.

I look forward to your continued help and generosity as we work together to find cures for dengue, West Nile, hepatitis C, yellow fever, and Leishmania diseases.

All my best, and many thanks!

Stan

P.S. Although completed, DDDT-1 will remain officially active on the grid. From time to time, we will need to test additional drug targets to help refine our evolving drug predictions, so do not be surprised if new DDDT-1 workunits show up in your cache.
[Aug 26, 2009 7:20:07 PM]

e stato generale di sub-progetti in attiva, inclusive gli informazione a sopra:

http://tinyurl.com/WCGACT

Mille grazie per aver riportato qui questo interessantissimo passaggio sullo stato dei lavori di Discovering Dengue Drugs!

E complimenti davvero per 1700 di rac su wcg!

Qualche molto strano:

Statistiche WCG a qui, probabile inalterabile per 3 settimane:

9762 15 569 19'607'383 47'163

Statistiche a BOINCstats.

World Community Grid 3 1 0 73 21,032,938 54,471 369,287 1,604,834 47,825

Statistiche nel file export a WCG: www.worldcommunitygrid.org/boinc/stats/team.gz

<team>
<id>9762</id>
<type>1</type>
<name>BOINC.Italy</name>
<userid>268497</userid>
<total_credit>21032938.165427</total_credit>
<expavg_credit>47825.448450</expavg_credit>
<expavg_time>1251310486.941280</expavg_time>
<founder_name>[HWU] GHz</founder_name>
<create_time>1141421115</create_time>
<url>www.boincitaly.org
<name_html>BOINC.Italy</name_html>
<description>BOINC.Italy: l'Italia nel calcolo distribuito. Entra anche tu a far parte della più grande community italiana per portare in alto la nostra bandiera! Visitate il nostro portale all'indirizzo www.boincitaly.org dove troverete informazioni e news sul team, su tutto quello che riguarda BOINC e sui vari progetti seguiti dal team. Che state aspettando a supportare BOINC.Italy? Con il vostro aiuto possiamo fare ancora di più!
<country>ITALY</country>
</team>

Bug?

i crediti in questo portale vengono contati solo da quando l'utente è entrato nel team. Su BoincStats e sul sito WCG, invece, l'utente si porta dietro nel team il pacchetto di crediti che aveva fatto prima di entrarci.

Quindi, a voler ben vedere, siamo noi quelli a calcolare troppo onestamente i numeri!

Sbaglio? Ero giunto a questa conclusione proprio analizzando i miei numeri, siccome differivano tra qui e boincstats

Sekerob ha scritto:

Mio secondo messagio Update per

"Discovering Dengue Drugs - Phase 1 – DONE" !

All Phase 1 results that you have generated are now on our disk servers where they are being compiled, processed and double-checked. Thank for your efforts and help!

Phase 1 is only the first step on our path to discovering dengue (and West Nile, hepatitis C, yellow fever, and Leishmania) drugs. Phase 1 has systematically tested ~3 million small "drug-like" molecules against 18 different protein targets (12 viral protease targets, 6 Leishmania enzymes). These 54 million individual docking experiments were completed in less than 2 years, even with the devastating interruptions and slowdowns wrought by Hurricane Ike. Our 30-node high-performance cluster would have needed to run nonstop for 205 years to finish these calculations.

Phase 1 identified several thousand molecules that could interact with each target protein. Typically, ~90-95% of Phase 1 “hits” turn out to be false positives when tested in the laboratory. Thus, Phase 1 hits are very inefficient to pursue with laboratory testing.

"Discovering Dengue Drugs - Phase 2" is designed to reduce the number of Phase 1 false positives. In Phase 2, we will complete ~2000 computationally demanding free energy calculations for each protein target (each calculation uses a promising Phase 1 hit). These calculations will eliminate many of the Phase 1 false positives and produce refined hit lists that are expected to contain ~80% true positives. Testing Phase 2 hits in the laboratory will be much more productive, efficient, and rewarding than testing Phase 1 hits. For example, to find 25 small molecules that stop dengue virus replication in the laboratory, we would need to synthesis and test either 250-500 Phase 1 hits or ~30 Phase 2 hits. We like the improved odds provided by the Phase 2 calculations.

Alpha testing has begun for "Discovering Dengue Drugs – Phase 2". This work is moving along remarkably smoothly (special thanks to the IBM team of professionals). Beta testing and Phase 2 will launch very very shortly.

I look forward to your continued help and generosity as we work together to find cures for dengue, West Nile, hepatitis C, yellow fever, and Leishmania diseases.

All my best, and many thanks!

Stan

P.S. Although completed, DDDT-1 will remain officially active on the grid. From time to time, we will need to test additional drug targets to help refine our evolving drug predictions, so do not be surprised if new DDDT-1 workunits show up in your cache.
[Aug 26, 2009 7:20:07 PM]

e stato generale di sub-progetti in attiva, inclusive gli informazione a sopra:

http://tinyurl.com/WCGACT

Finito il Dengue? Io ho ricevuto una WU in tre mesi!!!

Dal prospetto noto che anche il cep è quasi finito (oltre 85 %), ma io non so nemmeno come sia lo screensaver; non è ho ricevuta una. Mi arrivano distrofie a nastro...

cenit ha scritto:

i crediti in questo portale vengono contati solo da quando l'utente è entrato nel team. Su BoincStats e sul sito WCG, invece, l'utente si porta dietro nel team il pacchetto di crediti che aveva fatto prima di entrarci.

Quindi, a voler ben vedere, siamo noi quelli a calcolare troppo onestamente i numeri!

Sbaglio? Ero giunto a questa conclusione proprio analizzando i miei numeri, siccome differivano tra qui e boincstats

No, in questo portale le statistiche vengono importate direttamente dagli account dei vari progetti, nessun conteggio da quando si è entrati nel team.

morris83, per controllo esatto, selezionare tua progetti specifiche a My Grid > Device Manager > Device Profile. CEP e FLU hanno una peso basso nel distributore... risultate limitate.

morse/cenit,

fattualmente i valore none aggiungere una volta dopo miei trasferta a BOINC.Italy.

Oggi il totale ancora :

9762 15 569 19'607'383 47'163

È fatto... qualche e caduto nel il processo di importazione.

modifica:

Statistiche ancora bene:

9762 15 569 21'088'314 48'174

Sekerob ha scritto:

morse/cenit,

fattualmente i valore none aggiungere una volta dopo miei trasferta a BOINC.Italy.

Oggi il totale ancora :

9762 15 569 19'607'383 47'163

È fatto... qualche e caduto nel il processo di importazione.

modifica:

Statistiche ancora bene:

9762 15 569 21'088'314 48'174

Si c'era un problema con l'aggiornamento dei dati totali del team perchè evidentemente hanno cambiato qualcosa sul server di WCG, ora funziona, grazie per la segnalazione!

Una domanda: di dove sei?

Ciao,
GHz

Qui



esattamente