ARGOMENTO:

Sembra che ci sia un altro pò di lavoro:

Hello, we are a group of researchers from the Laboratory of translational architectomics, working on spinal muscular atrophy (SMA), a neurodegenerative disease.
We are working on a project which aims at identifying correlation between genes and features depending on the disease condition. To do so, we need to perform mouse gene network expansion with ribosome profiling data (RiboSeq) from control and SMA samples of multiple tissues.

Il buon Valter ha permesso di identificare questo nuovo lavoro:

I just put a small number of the new workunits into the queue, their names contain the string _Mm_.
They should be quite fast, around twenty minutes on my benchmark computer, probably half of this on a modern cpu.

Altre novità scientifiche dal progetto:

Hello everyone!
We are a group of students attending the Laboratory of Data Mining at the University of Trento and we are trying to study the crosstalk between epitranscriptomic and histone modifications in the context of lung adenocarcinoma (LUAD).
Starting from a dataset containing both lung cancer samples and healthy controls, we wish to expand a set of genes of interest involved in cancer onsetting and in the mentioned cross-talk to then perform further anlayses. The name of our work unit will contain the string 'dfcc_e'.

Aspettiamo queste nuove wus!!

Sembra che ci siano delle novità importanti riguardo la problematica dischi che affligge, da tempo, il progetto.
Il buon Valter ha scritto:

The University have bought a new one and they planned the moving procedure. The HPC cluster should be moved this Monday (March, 6th), the other resources will follow.
I will reasonably shut down the server when needed, I will tell you when as soon as I know the date. Meanwhile the work generator will be active just a few hours a day, so very few workunits will be available.
Thank you all for your understanding and patience.

Dai che con il nuovo cluster le cose andranno meglio, dai!!

Messaggio 3133 - Messaggi: 7 Apr 2023, 14:11:13 UTC


At our current pace the remaining workunits related to the very long and computational intensive FANTOM-1 experiment (started in March 2018) will be distributed in more or less two days. This will be the end of this job.

For the future of the gene@home project please look at this thread
gene.disi.unitn.it/test/forum_thread.php?id=366

E' la prima volta che sento parlare di questo progetto Fantom-1

Vedi qui

Da ValterC

Messaggio 3152 - Messaggi: 28 Apr 2023, 15:15:44 UTC


Right now that our queue is empty it is the perfect time to switch our filesystem to the new one and to upgrade the operating system of the server. This will probably happen the 2nd of May, for a couple of days. During this period the server may be down for awhile. After that, if everything will go smoothly, we plan to start distributing work again.

Aggiornamento completato:

- the server is now running using the new filesystem
- the server has been updated to Ubuntu 20
I will keep BOINC switched off for a while until I fix the usual PHP problems in the web pages (please tell me if you find any of them)

The next experiment should be on Vitis vinifera but the preparation work for another one on Humans is also almost done.

Ci sarà ancora della Vitis Vinifera da simulare e poi si torna ancora ad analisi genetiche sull'essere umano.

Sembrerebbe, a breve, la ripresa del progetto...

The first (test) workunits will be out today

boboviz ha scritto:

Sembrerebbe, a breve, la ripresa del progetto...

The first (test) workunits will be out today

Ad ora ne vedo rilasciate 619 tutte prese...

gene.disi.unitn.it/test/forum_thread.php?id=370

Messaggio 3164 - Messaggi: 12 May 2023, 16:26:14 UTC


Dear all, I am very excited to announce that a new bigger dataset of Vitis vinifera transcriptomic data (Vespucci) is now available for OneGene expansion. The number of experiments has more than tripled. We are still using the results from the previous analyses, finding very interesting gene associations and producing amazing gene networks. We now expect to improve and refine them with this new collection of runs. Many thanks to all of you.

da Stefania - Project scientist

TN-Grid sbarca su Twitter

Il progetto, tra qualche giorno, andrà in pausa (e il buon Valter a godersi le meritate ferie!!)
Si dovrebbe ripartire ad Agosto.

(oggi sono user of the day sul progetto, ma quello è il meno)
Per ora di lavoro all'orizzonte ancora niente.
Valter, i nostri pc sono assetati!!!

boboviz ha scritto:

(oggi sono user of the day sul progetto, ma quello è il meno)
Per ora di lavoro all'orizzonte ancora niente.
Valter, i nostri pc sono assetati!!!

Non vorremmo mica arrivare ad Halloween secchi, vero?

campos ha scritto:

boboviz ha scritto:

(oggi sono user of the day sul progetto, ma quello è il meno)
Per ora di lavoro all'orizzonte ancora niente.
Valter, i nostri pc sono assetati!!!

Non vorremmo mica arrivare ad Halloween secchi, vero?

Non vorremmo mica arrivare ad Halloween Natale secchi, vero?

E per capodanno ????

zioriga ha scritto:

E per capodanno ????

Chi arriva senza wu a Capodanno, resta senza wu tutto l'anno.

Novità all'orizzonte ??

(c'è scritto maybe....)