ARGOMENTO:

Capito, è un peccato però, perchè aiutava ancora di più a capire cosa (e come) si faceva

Sinceramente non avevo mai notato (e quindi usato) quella funzione... Me la sono persa...

Mi sono da poco convertito a Linux (Ubuntu ultima versione) e sto elaborando con Rosetta, solo che la grafica non c'è, nel senso che il pulsante per mostrare la grafica dell'elaborazione c'è ma non è cliccabile. Qualcuno sa come mai?

stessa cosa con seti beta

SickBoy88 ha scritto:

Mi sono da poco convertito a Linux (Ubuntu ultima versione) e sto elaborando con Rosetta, solo che la grafica non c'è, nel senso che il pulsante per mostrare la grafica dell'elaborazione c'è ma non è cliccabile. Qualcuno sa come mai?

Su Windows c'è, nella cartella X:\Boinc\projects\boinc.bakerlab.org_rosetta (quindi cerca nel percorso deciso in installazione), il file minirosetta_graphics(altre cose).exe.

Se ce l'hai è probabile che non giri perchè su Linux (a meno di Wine) gli exe, come ben saprai, non girano.

Però penso sia più probabile che non abbiano programmato niente in tal senso, quindi, purtroppo, se rilevano un sistema operativo Linux non scaricano nessun programma per mostrare la grafica, semplicemente perchè non esiste.

Se hai Wine posso provare a passarti l'exe di Windows e vedere se l'emulazione va a buon fine... Però dubito...

Ciao!!!

P.S. @Tiziano: Per SETI non ne ho idea, però potrebbe essere che il motivo (se è giusto questo) sia lo stesso...

Ti ringrazio ma fa lo stesso Era giusto una curiosità, non così importante ai fini dell'elaborazione

Si immaginavo... Piuttosto sono curioso io ora di sapere se esiste il file tipo quello di Windows nella cartella di rosetta...

Sinceramente non riesco a trovare neppure la cartella dove è installato boinc..

da me è in /var/lib/boinc-client/
dentro c'è la cartella projects e dentro ognuna di queste le varie applicazioni e wu.
Non ho attaccato rosetta, quindi non posso verificare, ma non credo vengano scaricati eseguibili windows in linux

Scusate il ritardo...

Oct 22, 2011
Journal post from David Baker

Today's issue of Science magazine describes an exciting new approach to HIV vaccine design using Rosetta. In contrast with other viruses such as polio and influenza, inactivated HIV or HIV proteins have not worked as vaccines, and hence as you know there is currently no effective HIV vaccine. Our approach to vaccine design is to take the bits of the HIV surface protein that people make antibodies to, and using Rosetta graft them onto small stable scaffolds that can be made in large quantities and potentially could be useful as vaccines. We've shown earlier that this can be done straightforwardly with Rosetta if the bits of the HIV protein are contiguous along the sequence, but it is much harder if the antibody recognizes multiple bits close in three dimensions but far in sequence. In this paper we show how such "discontinuous" epitipes can be transferred from HIV gp120 to a simple scaffold protein. More work will be required to determine whether this or other vaccine candidates designed using this approach will be effective as HIV vaccines-let us all hope so!!

News dal progetto - 22 ottobre 2011

L'edizione odierna del magazine Science descrive un nuovo, entusiasmante approccio alla definizione di vaccino per l'HIV usando Rosetta. Differentemente da altri virus, come poliomelite e influenza, bloccare l'HIV o le proteine dell'HIV non funziona come vaccino, quindi, ad ora, non esiste un vaccino HIV efficace. Il loro (di Rosetta) approccio alla definizione di un vaccino consiste nel "digitalizzare" la superficie della proteina verso cui le persone creano anticorpi, usando Rosetta per innestarle su piccole strutture stabili producibili in grande quantità e che possono essere utilizzate come vaccini. Hanno già mostrato come questo compito possa essere facilmente compiuto con Rosetta se i bit della proteina sono contigui nella sequenza, ma è molto più difficile se si ipotizza che gli anticorpi riconoscono le parti "sensibili" vicine nello spazio ma lontane nella sequenza. In questo articolo mostrano come gli antigeni "lontani" possono essere trasferiti dal HIV gp120 a una semplice struttura proteica. Altro lavoro sarà necessario per determinare se questo od altri vaccini potenziali definiti usando questo approccio diventeranno efficaci come vaccini per HIV. Cosa che speriamo tutti!!

SickBoy88 ha scritto:

Sinceramente non riesco a trovare neppure la cartella dove è installato boinc..

Quando usavo linux avevo scoperto che mancava un collegamento ad una libreria e quindi non funzionava la grafica. Prova a cercare su internet se c'è ancora questo problema

Ho controllato però tra i files, ed il file della grafica effettivamente non c'è proprio.

SickBoy88 ha scritto:

Ho controllato però tra i files, ed il file della grafica effettivamente non c'è proprio.

Probabilmente, allora, in linux non c'è

News del 26 Ottobre 2011

Aggiornato il software di Rosetta@Home alla versione 3.17.

David Baker ha vinto un altro premio, tra i tanti....

David Baker receives UW Medicine's Inventor of the Year award.

From the award announcement “ the Inventor of the Year award is given to individuals who have translated research from the bench, through partnerships with the biomedical industry, to a product or process that has had a major impact on healthcare and the local economy” .

David Baker receives UW Medicine's Inventor of the Year award.

From the award announcement “ the Inventor of the Year award is given to individuals who have translated research from the bench, through partnerships with the biomedical industry, to a product or process that has had a major impact on healthcare and the local economy” .

David Baker riceve il premio di UW Medicine's come Inventore dell'anno.

Dal comunicato del premio: "Il premio per l'Inventore dell'anno è attribuito individualmente a chi ha portato le ricerche dal banco del laboratorio, grazie alla collaborazione con industrie biomediche, ad un prodotto o ad un processo che ha dato un forte contributo alla sanità e all'economia locale.

Giusto per fare un elenco:

- 1994: Premio "Giovane Investigatore" dalla National Science Foundation
- 1994: Packard Fellowship in Science and Engineering
- 1995: Premio Beckman "Giovane Investigatore"
- 2000: Premio "Giovane investigatore" dalla Protein Society
- 2002: Premio Overton dall'International Society for Computational Biology
- 2004: Premio AAAS Newcomb Cleveland dall'American Association for the Advancement of Science
- 2004: Premio Feynman dal Foresight Institute
- 2008: Premio Sackler in Biofisica

Conditi con più di 230 pubblicazioni.

Mi stanno arrivando wu LigDoc. Stanno mettendosi a fare docking???

Anche a me... Però ora è giù il sito e non riesco ad indagare...

Pare che ci siano problemi con il validatore a seguito di un problema con i server.

Dal sito di Rosetta@home:

Rosetta@Home software updated to version 3.19

Aggiornato il client alla versione 3.19.