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sabayonino https://www.rinnovabili.it/energia/fotovoltaico/celle-in-perovskite-efficienze/ (06.12.21, 22:22)
Buro87 yafu (05.12.21, 21:18)
Buro87 io sono tornato su Rakesearch e (05.12.21, 21:18)
Buro87 Sì in realtà eravamo gia al sicuro ieri sera. comunque essere socuri non guasta comunque complimenti a tutti (05.12.21, 21:12)
zioriga io ho lavorato con 20 cores + NVidia 1080 e 970 e ATI 560 (05.12.21, 21:08)
zioriga questo sulla base del RAC, crescenti per alcuni e decrescenti per altri (05.12.21, 21:06)
zioriga sto seguendo il link che ho riportato, e, a spanne una classifica finale dei primi tre ci sono, in ordine: VarterC (l'inimitabile), io e poi una terza posizione, al fotofinish, tra DanieleG e il fantomatico SignorJ (illustre sconosciuto sul sito) (05.12.21, 21:05)
zioriga https://milkyway.cs.rpi.edu/milkyway/team_members.php?teamid=1301&offset=0&sort_by=expavg_credit (05.12.21, 21:02)
zioriga anch'io ho scaccolato di cpu (05.12.21, 21:00)
Spot T @zioriga: questa volta ci ho messo su anche tutte le cpu... (05.12.21, 18:30)
zioriga e terzi resteremo (05.12.21, 17:39)
Buro87 per ora siamo terzi (03.12.21, 09:17)
boboviz Si, vanno benone su Milky (02.12.21, 22:00)
tameta Presente con le GPU AMD 5xxx e 6xxx, spingono bene su Milkyway? (02.12.21, 20:29)
valterc Non sono mie, quelle... Ho delle Tesla V100 ma non disponibili questo weekend. Tenete duro, io recupero su MooWrapper (02.12.21, 20:22)
Buro87 se ricordo bene hai delle P100. che fanno 30s a wu. non mi sembrano 2lente" https://milkyway.cs.rpi.edu/milkyway/show_host_detail.php?hostid=799041 (02.12.21, 19:08)
valterc non posso aiutare molto, stavolta... le nvidia non sono adatte, milkyway non funziona con vega20/mi-50 + rocm (02.12.21, 18:52)
Spot T Cercasi possessori di Rx5xxx/6xxx (02.12.21, 17:55)
Nubman L'ultimo FB sprint è su Milkyway e inizia domani alle 05:00. Uscite le gpu AMD!!! (02.12.21, 08:55)
Antonio Cerrato secondo voi stiamo già "elaborando" la nuova variante omicron con rosetta o wcg? (01.12.21, 21:16)
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Pubblicazioni 03/08/2020 18:28 #134414

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Fatto il solito giro di aggiornamenti....


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Pubblicazioni 19/02/2021 22:16 #135684

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Altro giro di aggiornamenti semestrale (oltre ad aver spostato alcuni progetti nei chiusi e riportati in vita altri, tipo Van der Waerden)


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Pubblicazioni 19/06/2021 07:18 #136532

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Pubblicazioni WCG mancanti nell'elenco attuale
(inserisco anche quelle che ho segnalato nei giorni scorsi nel thread dedicato al WCG)

# Progetto Drug Search for Leishmaniasis
Carol V. Mesa et al. (2015) ‘In Silico Screening of Potential Drug with Antileishmanial Activity and Validation of their Activity by in Vitro and in Vivo Studies’, Journal of Chemistry and Chemical Engineering, 9(6). doi: 10.17265/1934-7375/2015.06.002.
Link: www.davidpublisher.o...dex.php/Home/Article/index?id=20345.html


# Progetto Computing for Clean Water
Xiong, W. et al. (2011) ‘Strain engineering water transport in graphene nanochannels’, Physical Review E, 84(5), p. 056329. doi: 10.1103/PhysRevE.84.056329.
Link: journals.aps.org/pre/pdf/10.1103/PhysRevE.84.056329



# Progetto "Microbiome Immunity Project"
- Gligorijević, V. et al. (2021) ‘Structure-based protein function prediction using graph convolutional networks’, Nature Communications, 12(1), p. 3168. doi: 10.1038/s41467-021-23303-9.
Link: www.nature.com/articles/s41467-021-23303-9



# Progetto "Discovery Dengue Drugs"
- Malmstrom, R. D. (2011) Discovering Dengue Drugs-Together: Grid Scale Virtual Screening with Mean Field Free Energy of Binding Rescoring. Dissertation. The University of Texas Medical Branch. Available at: hdl.handle.net/2152.3/763 .


# Progetto "Help Defeat Cancer"
- Yang, L. et al. (2007) ‘High Throughput Analysis of Breast Cancer Specimens on the Grid’, in Ayache, N., Ourselin, S., and Maeder, A. (eds) Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention – MICCAI 2007. Berlin, Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg, pp. 617–625. doi: 10.1007/978-3-540-75757-3_75.
Link: link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-540-75757-3_75


Yang, L. (2009) ‘Robust segmentation and object classification in natural and medical images’. doi: 10.7282/T3DN458J.
Link: rucore.libraries.rutgers.edu/rutgers-lib/26109/PDF/1/play/


Foran, D. J., Chen, W. and Yang, L. (2011) ‘Automated Image Interpretation Computer-Assisted Diagnostics’, Analytical Cellular Pathology, 34(6), pp. 279–300. doi: 10.1155/2011/239761.
Link: downloads.hindawi.com/journals/acp/2011/239761.pdf



# Progetto "AfricanClimate@Home"
- Tadross, M. et al. (2010) Modelling the Influence of Vegetation, Soil Moisture and Aerosols on Early Summer Southern African Climate. Report to the Water Research Commission WRC Report No. 1681/1/10. Available at: www.wrc.org.za/wp-content/uploads/mdocs/1681-1-101.pdf .


# Progetto The Clean Energy Project
Aspuru-Guzik, A. (2016) Towards 3rd generation organic tandem solar cells with 20% efficiency: Accelerated discovery and rational design of carbon-based photovoltaic materials through massive distributed volunteer computing. DE--SC0008733, 1330957, p. DE--SC0008733, 1330957. doi: 10.2172/1330957.
Link: www.osti.gov/servlets/purl/


Amador-Bedolla, C. et al. (2013) ‘Organic Photovoltaics’, in Informatics for Materials Science and Engineering Data-driven Discovery for Accelerated Experimentation and Application. Butterworth-Heinemann. Available at: doi.org/10.1016/B978-0-12-394399-6.00017-5.

Olivares-Amaya, R. (2012) Quantum Chemistry in Nanoscale Environments: Insights on Surface-Enhanced Raman Scattering and Organic Photovoltaics. Doctoral dissertation. Harvard University. Available at: nrs.harvard.edu/urn-3:HUL.InstRepos:9453699.

Pyzer-Knapp, E. O., Simm, G. N. and Aspuru Guzik, A. (2016) ‘A Bayesian approach to calibrating high-throughput virtual screening results and application to organic photovoltaic materials’, Materials Horizons, 3(3), pp. 226–233. doi: 10.1039/C5MH00282F.
Link: pubs.rsc.org/ko/content/getauthorversionpdf/C5MH00282F



# Help Cure Muscolar Dystrophy
Nadalin, F. and Carbone, A. (2018) ‘Protein–protein interaction specificity is captured by contact preferences and interface composition’, Bioinformatics. Edited by A. Valencia, 34(3), pp. 459–468. doi: 10.1093/bioinformatics/btx584.
Link: academic.oup.com/bio...article-pdf/34/3/459/25117036/btx584.pdf


Sacquin-Mora, S. (2011) Représentations gros-grain pour la modélisation des protéines : Propriétés mécaniques et interactions. Université Paris-Diderot - Paris VII. Available at: tel.archives-ouvertes.fr/tel-00652917/document.


# Progetto FightAIDS@Home
Deng, N. et al. (2015) ‘Distinguishing Binders from False Positives by Free Energy Calculations: Fragment Screening Against the Flap Site of HIV Protease’, The Journal of Physical Chemistry B, 119(3), pp. 976–988. doi: 10.1021/jp506376z.
Link: pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/jp506376z


Lin, Y.-C. et al. (2011) ‘Structural basis for drug and substrate specificity exhibited by FIV encoding a chimeric FIV/HIV protease’, Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography, 67(6), pp. 540–548. doi: 10.1107/S0907444911011681.
Link: scripts.iucr.org/cgi-bin/paper?S0907444911011681



# Progetto OpenZika
Ekins, S. et al. (2020) ‘Déjà vu: Stimulating open drug discovery for SARS-CoV-2’, Drug Discovery Today, 25(5), pp. 928–941. doi: 10.1016/j.drudis.2020.03.019.
Link: www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1359644620301458
Ringraziano per il messaggio: boboviz, sabayonino

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Pubblicazioni 13/07/2021 12:28 #136569

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Come su suggerimento del buon Nik78 ho cominciato una "transizione" dei link delle pubblicazioni al sistema DOI.
La cosa sarà "mista":
- DOI per i link generici, agli abstract
- vecchi link diretti ai pdf che sono inaccessibili via DOI.

Per dire, tutti i vecchi link del progetto GPUGRID sono sbagliati, avendo spostato tutto su altre piattaforme...

Mi ci vorranno settimane


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Ringraziano per il messaggio: sabayonino, NiK78, Antonio Cerrato, corla99

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Pubblicazioni 27/08/2021 22:16 #136640

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Nuova pubblicazione in arrivo per il progetto Help Cure Muscolar Dystrophy del WCG.

Per il momento abbiamo il pre-print.
- Dequeker, C. et al, From complete cross-docking to partners identification and binding sites predictions, pre-print, doi: 10.1101/2021.08.22.457276
Link: www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.08.22.457276v1

Qui l'annuncio della prof.ssa Carbone: Invalida chiave consumatore / segreta in configurazione
(magari fatelo ri-twittare dall'account del gruppo)
Ringraziano per il messaggio: boboviz

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Pubblicazioni 16/09/2021 17:13 #136681

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Mi ci vorranno settimane


Son stato troppo ottimista :muro:


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Pubblicazioni 28/11/2021 23:30 #136993

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Son stato troppo ottimista :muro:


Finita!! Finita!!
Ho passato, dove ho potuto, i link al sistema DOI .
Inoltre: moltissimi link sono passati da http ad https e alcuni progetti avevano cambiato completamente sito (gpugrid, per esempio).

Adesso un pò di riposo, poi il solito "aggiornamento" periodico.


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