BOINC.Italy
La community italiana dedicata al calcolo distribuito
David Baker, il responsabile del progetto Rosetta, ha pubblicato una lettera in cui ringrazia i partecipanti del progetto e aggiorna sullo stato del progetto, compresi i fondi che varie agenzie governative hanno assegnato al team di ricerca.
Qui maggiori dettagli.
Gli amministratori hanno reso disponibile la nuova versione dell'applicativo (la 3.52), che contiene un paio di bugfix relativi alla modellazione simmetrica. In caso di problemi siete pregati di postarli sul forum del progetto.
I ricercatori hanno scoperto come creare alcune nuove classi di proteine e Rosetta@Home è stata assolutamente fondamentale in questo lavoro: quando viene progettata una nuova struttura, l'ultima cosa (prima di ordinare un gene sintetico così da poter creare una proteina in laboratorio) che fanno è quella di inviarla ai volontari per predire la struttura - se si "piega" come hanno progettato, vanno avanti con essa, ma se scoprono che lo stato di energia più basso è una struttura diversa, tornano al tavolo di progettazione.
Adoro Rosetta...ma anche CAS non è male...
non vedo nulla in firma .... 
aaz ... ci sta sul badg inferiore ... maledetto ! hai almeno 100 crediti di RAC più di me ! 
il motivo di questo tasso di successo è che i calcoli di Rosetta sono molto stringenti riguardo il "piegarsi" delle strutture progettate.
anche un pò tirchietti . ma va bene così 
Qui i dettagli della nuova pubblicazione del team di Rosetta.
La versione è stata aggiornata alla release 3.46 per includere i recenti sviluppi nella densità degli elettroni e in altre misurazioni. Questo update risolve inoltre un bug nei calcoli del gradiente di densità che ha, in alcuni casi, causato il crash dell'applicazione nelle simulazioni lunghe. Se ci sono problemi, vi invitiamo a postarli sul forum.
Una nuova proteina progettata dal team di Rosetta (la Toca 511) offre nuove speranze per i malati di glioblastoma (tumore del cervello). I test in vitro, su modelli animali e i primi sull'uomo stanno dando risultati molto incoraggianti. Maggiori informazioni qui
Alla fine degli anni 90/primi 2000 una persona mi ha fatto conoscere il calcolo distribuito dopo averlo installato sul pc su cui lavorava tutti i giorni (seti che tutti conosciamo ma anche United Devices che forse a qualcuno non dice nulla); purtroppo poco tempo dopo ha perso la battaglia contro quella gran brutta bestia che è il glioblastoma. E' grazie a lui se vivo e conosco questo mondo, ed è anche in suo ricordo che nel 2009 ho ripreso stabilmente a macinare wu.
Dopo questa notizia relativa al progetto Rosetta non posso far altro che cercar di garantire, per quanto sia possibile, il mio apporto a questo progetto; probabilmente il lavoro di un singolo pc è pressochè insignificante ma è come se continuassi ciò che aveva cominciato lui molti anni fa e in parte mi aiuta a tenerne vivo il ricordo... ciao papà
Alla fine degli anni 90/primi 2000 una persona mi ha fatto conoscere il calcolo distribuito dopo averlo installato sul pc su cui lavorava tutti i giorni (seti che tutti conosciamo ma anche United Devices che forse a qualcuno non dice nulla); purtroppo poco tempo dopo ha perso la battaglia contro quella gran brutta bestia che è il glioblastoma. E' grazie a lui se vivo e conosco questo mondo, ed è anche in suo ricordo che nel 2009 ho ripreso stabilmente a macinare wu.
Dopo questa notizia relativa al progetto Rosetta non posso far altro che cercar di garantire, per quanto sia possibile, il mio apporto a questo progetto; probabilmente il lavoro di un singolo pc è pressochè insignificante ma è come se continuassi ciò che aveva cominciato lui molti anni fa e in parte mi aiuta a tenerne vivo il ricordo... ciao papà
PS: perdonatemi per il messaggio "personale" e clamorosamente triste ma dopo aver visto l'articolo ho avvertito un'insolita sensazione e sentivo il bisogno di scrivere e condividere queste poche righe.
Ora un bel sorriso
e giù a scaccolare come forsennati
Al giorno.d'oggi è difficile sentire e leggere queste parole sui forum e nella vita reale.boboviz ha scritto:
Becks555 ha scritto:
PS: perdonatemi per il messaggio "personale" e clamorosamente triste ma dopo aver visto l'articolo ho avvertito un'insolita sensazione e sentivo il bisogno di scrivere e condividere queste poche righe.
Hai fatto bene...
Becks555 ha scritto:
PS: perdonatemi per il messaggio "personale" e clamorosamente triste ma dopo aver visto l'articolo ho avvertito un'insolita sensazione e sentivo il bisogno di scrivere e condividere queste poche righe.
PS: perdonatemi per il messaggio "personale" e clamorosamente triste ma dopo aver visto l'articolo ho avvertito un'insolita sensazione e sentivo il bisogno di scrivere e condividere queste poche righe.
Alla fine degli anni 90/primi 2000 una persona mi ha fatto conoscere il calcolo distribuito dopo averlo installato sul pc su cui lavorava tutti i giorni (seti che tutti conosciamo ma anche United Devices che forse a qualcuno non dice nulla); purtroppo poco tempo dopo ha perso la battaglia contro quella gran brutta bestia che è il glioblastoma. E' grazie a lui se vivo e conosco questo mondo, ed è anche in suo ricordo che nel 2009 ho ripreso stabilmente a macinare wu.
Dopo questa notizia relativa al progetto Rosetta non posso far altro che cercar di garantire, per quanto sia possibile, il mio apporto a questo progetto; probabilmente il lavoro di un singolo pc è pressochè insignificante ma è come se continuassi ciò che aveva cominciato lui molti anni fa e in parte mi aiuta a tenerne vivo il ricordo... ciao papà
PS: perdonatemi per il messaggio "personale" e clamorosamente triste ma dopo aver visto l'articolo ho avvertito un'insolita sensazione e sentivo il bisogno di scrivere e condividere queste poche righe.
Ora un bel sorriso
e giù a scaccolare come forsennati
Giusto per capire quanto venga tenuto in considerazione il team di rosetta, ecco una donazione di 1.4 milioni di $ da parte del Life Sciences Discovery Fund per sviluppare la ricerca proteica su pc...
LSDF
Pure da noi in Italia.....
probabilmente ai volontari fanno fare il "lavoro sporco"
, poi prendo i vari risultati , li daranno in pasto ai loro pc .... et voilà
Our new Institute for Protein Design is making considerable progress as you can see at depts.washington.edu/ipd/. we are now using Rosetta@home to rigorously evaluate all computer-based designs before we create synthetic genes to make the proteins in the laboratory. this is dramatically increasing our success rate at designing proteins with new functions. your contributions continue to be absolutely invaluable!
io sono andato a surfare un po sul sito, ma non è spiegato se la modellazione di queste proteine è stato frutto del progetto Rosetta@home quanto piuttosto frutto del programma Rosetta che gira sui computer centrali dell'Università di Washington.
Infatti, altrimenti poi loro.cosa.ci guadagnano, oltre al fatto.di.far scaccolare a volontari?@Zio
probabilmente non avranno fatto accenno al calcolo distribuito ed alla sua struttura.
sicuramente la protiena sarà stata creata nei loro elaboratori (e laboratori) .
probabilmente ai volontari fanno fare il "lavoro sporco"
Attenzione: Spoiler!
, poi prendo i vari risultati , li daranno in pasto ai loro pc .... et voilà 
io sono andato a surfare un po sul sito, ma non è spiegato se la modellazione di queste proteine è stato frutto del progetto Rosetta@home quanto piuttosto frutto del programma Rosetta che gira sui computer centrali dell'Università di Washington.
Now ~8 years later, the code for a protein with features like the thermostabilized Rosetta designed yCD has been incorporated into a novel retroviral gene therapy replicating vector
. I ricercatori di Rosetta hanno imparato come progettare una nuova classe di proteine che possono essere usate sia come medicinali che come sensori. Queste proteine sono piccole molecole con meno di 50 atomi. Ci sono molti medicinali, come gli anticoaugulanti, che possono essere molto pericolosi se assunti in grandi dosaggi. Hanno avuto successo nel progettare proteine che si uniscono a specifiche molecole in maniera molto stretta; queste proteine possono essere usate come antidoti in caso di overdose - per esempio è stata progettata una proteina che può controllare la tossicità causata dall'overdose del farmaco "digoxin" utilizzato per problemi cardiaci. Con i collaboratori stanno lavorando per utilizzare queste proteine per identificare i livelli delle molecole bersaglio nel sangue o nell'ambiente in cui si sviluppano
