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Anche il progetto Folding comincia ad elaborare
simulazioni sul Coronavirus
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LB89IT [Toscana]
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si posso selezionare wu specifiche per il corona virus?
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boboviz
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si posso selezionare wu specifiche per il corona virus?
Per ora sembra di no, ci stanno lavorando.
Vi terrò informati appena esce qualcosa su Twitter (su cui sono molto attivi).
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sabayonino
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Un
tweet di Greg Bowman
(più di uno)
For those interested in contributing to the @foldingathome
projects on COVID-19 / 2019-nCoV, please select the "Any Disease" category
twitter.com/drGregBowman
Ci stanno lavorando. Al momento selezionare "Any desease" e sperare che nella lotteria delle eleborazioni ci caschi una COVID.19
Ringraziano per il messaggio: LB89IT [Toscana]
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LB89IT [Toscana]
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per il momento allora tengo rosetta, in caso mettano la possibilità di selezionare le wu dividerò un po' la cpu...
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sabayonino
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Da un
post
sul forum
Così a naso , sembra che dovranno rilasciare un nuovo client aggiornato. Non ci sono date ma dei generici "presto"/"appena possibile"
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boboviz
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Non ci sono date ma dei generici "presto"/"appena possibile"
Calcolando che prima del Corona stavano anche lavorando su un grosso aggiornamento del Core del progetto...
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boboviz
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Alcune novità di ieri pomeriggio:
This is rapidly evolving, but we are currently focusing on two different potential SARS-CoV-2 targets for COVID-19:
1. Understanding the structure of the part of the viral spike protein (called the RBD) and how it interacts with the human ACE2 cell required for viral entry. By simulating the RBD in isolation and in complex with ACE2, we can hopefully produce useful models that other researchers can use to develop therapeutic antibodies or small molecules that interfere with viral entry.
2. We have just set up the viral protease target from the recently released protease structure. This might be a useful target for repurposing small molecules or developing new ones that interfere with the viral life cycle.
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Nubman
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Non mi è chiaro: le GPU sono supportate? E in caso affermativo, per quanto mi riguarda, quelle NVIDIA sì?
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sabayonino
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Gentoo||KDE
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Per il pinguino ... A me si (nvidia drivers)
Ringraziano per il messaggio: Nubman
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boboviz
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Prima wus per gpu dedicata al Corona è arrivata sul mio pc...
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teosivi
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Ciao ragazzi, non ho mai scaccolato su folding. le WU lavorano solo su GPU o ci sono alcune su CPU?
Grazie. Matteo
scaccolo su:
-macbook pro 13" retina late 2013 (intel Core i5 dual-core a 2,4GHz Turbo Boost fino a 2,9GHz 8GB di ram a 1600MHz ssd 256GB, Intel Iris Graphics
- Lenovo Intel(R) Core(TM) i7-6600U CPU @ 2.60GHz [Family 6 Model 78 Stepping 3] - 20GB ram
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boboviz
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Ciao ragazzi, non ho mai scaccolato su folding. le WU lavorano solo su GPU o ci sono alcune su CPU?
Io, per ora sto scaccolando su gpu.
Devo ancora fare un salto sul loro forum per vedere se c'è anche la versione cpu del progetto.
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boboviz
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Devo ancora fare un salto sul loro forum per vedere se c'è anche la versione cpu del progetto.
Sembra di no:
All projects are using the new OpenMM GPU Core22.
11741: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) receptor binding domain in complex with human receptor ACE2. atoms: 165550, credit: 15396
11742: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) protease in complex with an inhibitor. atoms: 62227, credit: 9405
11743: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) protease - potential drug target. atoms: 62180, credit: 9405
11744: Coronavirus SARS-CoV (SARS causing virus) receptor binding domain trapped by a SARS-CoV S230 antibody. atoms: 109578, credit: 7608
11745: Coronavirus SARS-CoV (SARS causing virus) receptor binding domain mutated to the SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) trapped by a SARS-CoV S230 antibody. atoms: 110370, credit: 7685
11746: Coronavirus SARS-CoV-2 (COVID-19 causing virus) receptor binding domain in complex with human receptor ACE2 (alternative structure to 11741). atoms: 182699, credit: 16615
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boboviz
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Devo ancora fare un salto sul loro forum per vedere se c'è anche la versione cpu del progetto.
Sembra di no:
All projects are using the new OpenMM GPU Core22.
E invece no.
Bowman, il capo del progetto, ha detto su Twitter che a breve rilasceranno anche il client per cpu.
Daje
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xdarma
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...dove il mondo diventa mancino...
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Non ho capito come funziona la cosa.
Arrivano da sole le WU ?
PS : come non detto ne ho beccato una 14530 (0, 1507, 8) 2 hours 39 mins
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E' da ore che è cosi e non scarica nulla, cosa posso fare secondo voi?
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xdarma
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C'è anche
questo
messaggio che può spiegare il blocco in scaricamento:
A couple of big cloud computing companies have dedicated serious resources to the project. By serious I mean 6,000 gpu's from one and over 60,000 idle cpu cores from another. These are causing unprecedented demand on the server infrastructure. F@H usually issues around ~4k WU per hour on average, this morning its at over ~27k.
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