ARGOMENTO:

grazie rick!

la cosa strana è che le wu me le ha fatte abbandonare prima di assegnarle al terzo utente... BOH!

Da questo mese si aspettano tre mesi di lavoro ininterrotto a causa di 5,5 milioni di nuove proteine importate dal database NCBI.

Ma già vedo che il tempo stimato di esecuzione sul sito è ben più lungo (circa 10 mesi)

Workunits for September upcoming
During the last week we have imported more than 5.5 million new proteins into SIMAP. This was due to a major change in the structure of the NCBI RefSeq database, which is covered by SIMAP.

The workunits for these many new protein sequences will be available from Sun, Sep 1. Due to the unusually many new proteins we expect about three months of continuous work for SIMAP.

Best,
Thomas

30 Aug 2013 | 13:23:55 UTC

ci sto già sotto da un paio di giorni ... e ne ho scorta suff

Versione beta per android disponibile!

The beta version of a simap app for android is now available. We invite smarthone and tablet owners to test the app and hope that no major problems occur. Please report problems in the "Forum" section of the boincsimap home page.

Cheers
Thomas

A mia domanda diretta se stiano lavorando su un client gpu hanno risposto così

The GPU tests we performed in SIMAP so far did not show substantial speedups. Seems the Smith-Waterman algorithm does not benefit very much, compared to the overhead introduced.
We have seen much better improvement by an optimal use of SIMD (SSE and AVX). Therefore we concentrate on SIMD in the development of the new Smith-Waterman application for SIMAP. Other projects might benefit more from GPUs than us.

Se introducessero le AVX.....

Qualcuno che lo ha provato su android?

MA19-GORICIZZA-86MI ha scritto:

Qualcuno che lo ha provato su android?

Io, gira decisamente bene, provato su un HTC Sensation @1512MHz (boincsimap.org/boincsimap/show_host_detail.php?hostid=792665) ed un Galaxy Mini @846MHz (boincsimap.org/boincsimap/show_host_detail.php?hostid=793195)

BananaJesus ha scritto:

MA19-GORICIZZA-86MI ha scritto:

Qualcuno che lo ha provato su android?

Io, gira decisamente bene, provato su un HTC Sensation @1512MHz (boincsimap.org/boincsimap/show_host_detail.php?hostid=792665) ed un Galaxy Mini @846MHz (boincsimap.org/boincsimap/show_host_detail.php?hostid=793195)

Gran terminale il l'htc sensation

MA19-GORICIZZA-86MI ha scritto:

Qualcuno che lo ha provato su android?

boboviz ha scritto:

A mia domanda diretta se stiano lavorando su un client gpu hanno risposto così

The GPU tests we performed in SIMAP so far did not show substantial speedups. Seems the Smith-Waterman algorithm does not benefit very much, compared to the overhead introduced.
We have seen much better improvement by an optimal use of SIMD (SSE and AVX). Therefore we concentrate on SIMD in the development of the new Smith-Waterman application for SIMAP. Other projects might benefit more from GPUs than us.

Se introducessero le AVX.....

Immagino che parlasse almeno delle SSE2 visto che il client lavora al 90% sugli interi e leggendo qui vedo che le SSE riguardano solo i float, solo dalle SSE2 ci sono istruzioni anche per gli integer.
In ogni caso se riuscissero a guadagnare tanto quanto hanno fatto quelli di asteroids probabilmente il progetto riuscirebbe a tornare periodico, ora sono mesi se non anni che ha lavoro continuo, segno credo, che la potenza fornita è minore di quella necessaria.

astroale ha scritto:

Immagino che parlasse almeno delle SSE2 visto che il client lavora al 90% sugli interi e leggendo qui vedo che le SSE riguardano solo i float, solo dalle SSE2 ci sono istruzioni anche per gli integer.

Spererei ALMENO le SSE3....

In ogni caso se riuscissero a guadagnare tanto quanto hanno fatto quelli di asteroids probabilmente il progetto riuscirebbe a tornare periodico, ora sono mesi se non anni che ha lavoro continuo, segno credo, che la potenza fornita è minore di quella necessaria.

Credo sia anche legata al fatto che stanno ricalcolando tutto con il nuovo protocollo....

danieleg ha scritto:

Versione beta per android disponibile!

The beta version of a simap app for android is now available. We invite smarthone and tablet owners to test the app and hope that no major problems occur. Please report problems in the "Forum" section of the boincsimap home page.

Cheers
Thomas

Io ci sto facendo lavorare il mio cluster . A parte i primi giorni con numerose wu in errore, ora sembra tutto OK

Dovrebbe partire tra poco la beta del nuovo client (con il protocollo Smith-Waterman ), che dovrebbe includere anche una revisione del calcolo dei punteggi, che attualmente sono bassini...

boboviz ha scritto:

Dovrebbe partire tra poco la beta del nuovo client (con il protocollo Smith-Waterman ), che dovrebbe includere anche una revisione del calcolo dei punteggi, che attualmente sono bassini...

Proprio ora che l'ho sospeso perchè sono arrivato a 100.000

Cmq ottima notizia

Per ottenere le Wu Beta bisogna solo aver fortuna vero? Non hanno un progetto a parte di test giusto?

Talon ha scritto:

Non hanno un progetto a parte di test giusto?

No. Mi hanno risposto che sarà fatto sullo stesso server/url.
Al massimo abiliteranno la voce nel profilo utenti, dove scegliere se voler ricevere lavoro beta.

A domanda diretta se hanno una roadmap per il nuovo applicativo, ecco la risposta...

I cannot give a certain date yet, but according to Mathias (our developer) the first beta should be available in about two weeks

Grazie della news Bobo!
Restiamo in attesa

C'è qualcuno che può spiegarmi cosa significano i 2 seguenti termini:
Work distributed e Remaining che si trovano sul sito www.boincsimap.org/boincsimap/ ?
Grazie in anticipo

Simon ha scritto:

C'è qualcuno che può spiegarmi cosa significano i 2 seguenti termini:
Work distributed e Remaining che si trovano sul sito www.boincsimap.org/boincsimap/ ?
Grazie in anticipo

Non ne sono sicuro al 100%, ma visto che SIMAP non rilascia lavoro con continuità, ma un po' per volta dovrebbe significare che è in lavorazione dai clienti il 61% di quelle 64K workunit, ed è rimasto lavoro da distribuire per altri 8 giorni di calcolo.

Cmq è da un po' che non ci lavoro, potrei aver scritto qualche castroneria

Leggi i PVT, ti ho risposto