ARGOMENTO:

Ok andiamo allora pedalare!

Volevo segnalarvi il problema che ho visto in questo messaggio .
Prima lavorando sempre su HD non me ne ero mai accorto, sapete se si tratta un problema noto ?
Ovviamente con DClinux sto usando il client 5.10 a 64 bit.

Mi ero joinato a questo progetto nel lontano 2007, mai scaccolata una wu, non so perchè.
Ho cominciato in questi giorni, solo che ho visto cose strane e mi chiedo se siano normali:
1) Upload di decine di mega di risultato.
2) Tempi biblici per avere assegnato il credito

E' normale??

boboviz ha scritto:

...solo che ho visto cose strane e mi chiedo se siano normali:
1) Upload di decine di mega di risultato.
2) Tempi biblici per avere assegnato il credito

E' normale??

sull'upload non ho mai indagato ma sui tempi biblici non direi... se consideri SETI al confronto SIMAP è un missile

aha beccata!
boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/result.php?resultid=10520917

è proprio la 10081502.005920_1 del file tmp da 600 mega:

Per quanto riguarda gli upload di grandi dimensioni, avevo letto anni fa che era stato l'oggetto di un fix nel passaggio dal client 5.08 al 5.10, evidentemente la situazione non è ancora completamente stabile, oppure la causa non è solo nel client ma nel modo con cui vengono generate le WU, in tal caso probabile che nella generazione degli ultimi task gli sia sfuggito qualcosa.

baxnimis ha scritto:

sull'upload non ho mai indagato ma sui tempi biblici non direi... se consideri SETI al confronto SIMAP è un missile

Nel profilo ho delle wu da validare dall'altro ieri...boh

astroale ha scritto:

Per quanto riguarda gli upload di grandi dimensioni, avevo letto anni fa che era stato l'oggetto di un fix nel passaggio dal client 5.08 al 5.10, evidentemente la situazione non è ancora completamente stabile, oppure la causa non è solo nel client ma nel modo con cui vengono generate le WU, in tal caso probabile che nella generazione degli ultimi task gli sia sfuggito qualcosa.

Uso la versione 6.10.56 del client e ho visto almeno 3 wu spararmi upload da 27/28 mb

boboviz ha scritto:

astroale ha scritto:

Per quanto riguarda gli upload di grandi dimensioni, avevo letto anni fa che era stato l'oggetto di un fix nel passaggio dal client 5.08 al 5.10, evidentemente la situazione non è ancora completamente stabile, oppure la causa non è solo nel client ma nel modo con cui vengono generate le WU, in tal caso probabile che nella generazione degli ultimi task gli sia sfuggito qualcosa.

Uso la versione 6.10.56 del client e ho visto almeno 3 wu spararmi upload da 27/28 mb

Ah, naturalmente parlavo della 5.10 del client SIMAP non di quello BOINC.

Ho avuto pure questo errore in un paio di wu

20/08/2010 15:31:06 boincsimap Computation for task 10081502.028411_3 finished
20/08/2010 15:31:06 boincsimap Output file 10081502.028411_3_0 for task 10081502.028411_3 exceeds size limit.
20/08/2010 15:31:06 boincsimap File size: 258180600.000000 bytes. Limit: 100000000.000000 bytes

Il file di output è troppo grande??

boboviz ha scritto:

astroale ha scritto:

Per quanto riguarda gli upload di grandi dimensioni, avevo letto anni fa che era stato l'oggetto di un fix nel passaggio dal client 5.08 al 5.10, evidentemente la situazione non è ancora completamente stabile, oppure la causa non è solo nel client ma nel modo con cui vengono generate le WU, in tal caso probabile che nella generazione degli ultimi task gli sia sfuggito qualcosa.

Uso la versione 6.10.56 del client e ho visto almeno 3 wu spararmi upload da 27/28 mb

Anche a me ogni tanto vengolo uploadate WU da 27 mega e danno uno sproposito come crediti (circa 170, rispetto a 26-30 normali) pur mettendoci lo stesso tempo ad essere calcolate. Non so dirvi altro, il problema sembra riguardare cmq solo le WU della serie 1008502.

Ma non finisce mica mai sta Run? Cos'è, da Luglio che non si ferma?

Infatti secondo me ormai simap sta diventando sempre più un progetto a tempo pieno...
Solo due anni fa c'era l'assalto per due o tre giorni a inizio mese, poi si è allungato sempre di più, ultimamente i due o tre giorni erano di pausa tra un mese e l'altro, e adesso stiamo cominciando a elaborare sempre... E' probabile che questa tendenza si consolidi col tempo, io credo...

akd ha scritto:

Infatti secondo me ormai simap sta diventando sempre più un progetto a tempo pieno...
Solo due anni fa c'era l'assalto per due o tre giorni a inizio mese, poi si è allungato sempre di più, ultimamente i due o tre giorni erano di pausa tra un mese e l'altro, e adesso stiamo cominciando a elaborare sempre... E' probabile che questa tendenza si consolidi col tempo, io credo...

Appena ho tempo cercherò maggiori informazioni a riguardo. Comunque hanno ampliato il numero di database da confrontare quindi hanno molto più lavoro rispetto ad una volta...

The calculation of new simap workunits containing new sequences from public databases imported in September 2010 (simap app) and their domains (hmmer app) will start in the evening (UTC) of October 8th.

Le nuove wu verranno distribuite a partire dall'8 sera.

Powerdown on Oct 6/7
Due to a series of power losses of the complete building, our project was offline for almost a day. Unfortunately the repeated power losses caused a serious crash of the BOINC database. Thus we had to recover the database from backup, reverting it to the status by Oct 6, 0:00 a.m. We have manually recovered the result table from the crashed database and thus have granted all credits for results that have been successfully validated between the date of the last backup and the crash.

Sorry for the trouble,
best regards
Thomas

Probabilmente gli errori di "download failed" che vedo sui miei criceti sono dovuti a questo problema.

astroale ha scritto:

Powerdown on Oct 6/7
Due to a series of power losses of the complete building, our project was offline for almost a day. Unfortunately the repeated power losses caused a serious crash of the BOINC database. Thus we had to recover the database from backup, reverting it to the status by Oct 6, 0:00 a.m. We have manually recovered the result table from the crashed database and thus have granted all credits for results that have been successfully validated between the date of the last backup and the crash.

Sorry for the trouble,
best regards
Thomas

Probabilmente gli errori di "download failed" che vedo sui miei criceti sono dovuti a questo problema.

Mi sa proprio di si.

Grazie per la notizia!

Spiegato il down di oggi: questa volta sembra che abbiano perso anche un tot di risultati. Però sono in grado di assegnare lo stesso i crediti, e come al solito l'informazione è tempestiva, completa e trasparente.

Dicono anche che finito questo run sostituiranno l'hardware del server che, mi sembra, invariato dall'inizio del progetto 4 anni fà:
boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/server_hardware.php

Powerdown on Oct 11
We had again a power failure on the boinc server. This time the database stayd alive, but the server filesystem crashed dramatically. Although we use a journalling filesystem, the complete upload folder (containing all successfully uploaded but not yet validated results) got lost. As this area is highly dynamic, we did not include it into our daily backup plan so that we now cannot restore these results. As a workaround, we will grant these vanished results the same credits that are granted after validation of the workunits to the correct results. We are very sorry about this trouble. As a consequence, we will consider shutting down this project in 2 weeks and moving it to another, more safe hardware environment as soon as possible.

E' da un po' che non faccio il SIMAP, ma continua a mandare quelle pochissime WU all'inizio del mese, e poi basta o hanno cambiato? Perchè a me non arrivava mai niente.

Morris83 ha scritto:

E' da un po' che non faccio il SIMAP, ma continua a mandare quelle pochissime WU all'inizio del mese, e poi basta o hanno cambiato? Perchè a me non arrivava mai niente.

Hanno finito le WU. Per controllare devi andare sulla home e controllare se la riga sotto il Project status e' verde o rossa in questo momento e' The project has currently no work (see below).

Due righe giusto per segnalare che dopo i quasi tre mesi di elaborazione continua trascorsi, adesso per i problemi HW del server SIMAP, fino al nuovo anno non rilasceranno piu nuove WU:

Due to a series of problems with the recent hardware we decided that BOINCSIMAP should be moved to a new location onto new hardware. The project will therefore have no work until January 2011.

Ultime news dal SIMAP, c'e' anche una migrazione verso un nuovo URL:

BOINCSIMAP will move to a new location onto new hardware
Due to the move of parts of the BOINCSIMAP crew to Vienna in 2010, this project is now a joint project of the Technical University Munich and the University of Vienna.

The recent series of power faults, combined with defects of the UPS devices in our Munich facilities, has motivated us to move BOINCSIMAP now immediately to new hardware at the University of Vienna. This hardware is brand new and became available last week. We will now setup the new boinc servers (BOINC server, download-/upload server and database server) and run a first small test in December 2010. If everything works fine, the first full run of the new servers will start around January 7, 2011 after the new year holidays. We expect then 1..2 months of continuous work, as there are the new proteins of three months plus a couple of new metagenomes.

There will be a new URL for the project, but we will also keep the current URL operational for a longer period.

Thanks to all friends of SIMAP for your great work, help and the many discussions in the previous years. We look forward to another productive era starting next year.
Best regards from Vienna
Thomas
27 Oct 2010 20:25:27 UTC