ARGOMENTO:

Batch consistente.
Dal nome delle wu sembrano legate al CASP

Dopo MESI e MESI di completo silenzio, qualcosa si muove all'orizzonte.
Rilasciato un piccolo batch (circa 1500wu) del nuovo applicativo per linux.

Altro segno che il progetto, sembra, non è abbandonato.
Hanno rilasciato il nuovo applicativo per Android con l'ultima release dei sorgenti Rosetta.
Le code, però, per ora son vuote.

Finalmente un pò di lavoro.
Solo per Android, però

Dopo mesi e mesi di silenzio, è partita una nuova campagna di simulazione, con una nuova app sia per Windows/Linunx che per Android
Probabilmente legata alle novità che hanno preannunciato .
Accattateville!

Molto interessante:

We are also happy to announce the addition of the aarch64 platform for running Rosetta on linux ARM devices like Raspberry Pi. This was made possible with the tremendous help from a team of volunteer ARM developers and specialists who reached out to the lab and took on the project to successfully port Rosetta for the linux ARM platform. We will post an official announcement as soon as this goes into production on R@h.

Dopo un inizio stentato della app su dispositivi mobili (errori di memoria), da oggi le cose vanno meglio e, inoltre, stanno arrivando sul telefono anche wu "COVID-19".

boboviz ha scritto:

Dopo un inizio stentato della app su dispositivi mobili (errori di memoria), da oggi le cose vanno meglio e, inoltre, stanno arrivando sul telefono anche wu "COVID-19".

Che sia controproducente per Ralph andare a mettere wu covid?.. in fondo è un progetto in fase alfa..
Mi raccomando prima di joinare questo progetto perchè ha wu covid, leggetevi per benino il primo messaggio di questo thread.

ReLeon ha scritto:

boboviz ha scritto:

Che sia controproducente per Ralph andare a mettere wu covid?

Perchè? Hanno fretta di provare i nuovi protocolli di design. Ralph è la via migliore.

Mi raccomando prima di joinare questo progetto perchè ha wu covid, leggetevi per benino il primo messaggio di questo thread.

Quello sempre!! E' un progetto beta, con tutti i suoi rischi (wu non validate, errori, ecc)

Hanno rilasciato stanotte una nuova versione dell'app, la 4.13
Probabilmente è una versione "bugfix" senza grosse novità.

boboviz ha scritto:

Probabilmente è una versione "bugfix" senza grosse novità.

Le ultime parole famose:

The COVID-19 related updates to the 4.13 rosetta and rosetta_for_devices and 4.14 rosetta linux versions include a new target clash energy and fold-tree options to improve the interface design protocol. It will allow sampling with the ACE2 binding helix motif fixed along with the target and a fast target clash energy check. Successful binders using this protocol are already being tested and optimized in the wet lab but this will allow us to design many more candidates to increase our chances of designing successful binders with the most promising binder properties.

Please spread to word to help our Ralph@home testing efforts for this app. A broad range of platforms is desired. Thanks!

Oggi pomeriggio hanno rilasciato la versione 4.14 per linux per risolvere al volo un bug.
Hanno problemi con la grafica, però, e chiedono aiuto ai volontari.

Supporting graphics for linux is tough. The graphics uses OpenGL and GLUT but depend on some dynamic libs that may or may not be available among different linux versions. If anyone has suggestions for more general graphics support for linux, I'm all ears.

Quelli di Ralph sono scatenati.
Stanotte rilasciata la versione 4.15 per tutte le piattaforme.
Questa versione va a risolvere un bug importante per il Mac.
Hanno inoltre detto che stanno lavorando per ridurre la richiesta di ram delle wu (finalmente!)

Bobo, il tuo sogno è diventato realtà: stai gioendo, stai piangendo dalla gioia?
Sentire gli admin di Ralph già di per sé è un tuffo al cuore, non mi immagino questo.

Mi raccomando non girare per casa nudo e delirante eh!!!!!!!

ReLeon ha scritto:

Bobo, il tuo sogno è diventato realtà: stai gioendo, stai piangendo dalla gioia?
Sentire gli admin di Ralph già di per sé è un tuffo al cuore, non mi immagino questo.
Mi raccomando non girare per casa nudo e delirante eh!!!!!!!

Sei il solito scioccone!!
Ovviamente sono contento di questo rinnovato interesse per Ralph (e per Rosetta in generale) sia da parte dei volontari che da parte degli admin stessi i quali, diciamocelo, non sono mai stati il massimo in fatto di comunicazione.
La parte importante, però, è quella scientifica!!!

Ieri hanno rilasciato il nuovo applicativo 64 bit per MacOsx

Gli amministratori hanno passato il sito (e il progetto) sotto https.
Bisogna fare il detach/riaggancio del progetto.

Rilasciata una nuova versione dell'applicativo, la 4.17.
E, sui server, non c'è più traccia dello storico "rosetta mini" che era fermo, come sviluppo, da anni.
Finalmente sembra che ci sia qualche passo avanti anche dal punto di vista del sw.

boboviz ha scritto:

Rilasciata una nuova versione dell'applicativo, la 4.17.

Ci sono problemi con la grafica sotto Mac (e sembra pure sotto Linux).
Nessun problema segnalato con Windows.
Ci stanno lavorando.
Ah, le novità di questa versione riguardano il database

Rilasciata la nuova versione (4.18) che dovrebbe risolvere i problemi dello screensaver.
Per ora nessun problema sotto windows