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zioriga la risposta è semplice, attualmente le Wu per GPU sono solo per LInux (21.03.24, 11:39)
samu986 Buongiorno a tutti, sapete per caso se GPUGRID funziona bene? A me interessano le WU per GPU, infatti ho selezionato solo quelle, ma non mi arriva niente da mesi. Qualcuno potrebbe aiutarmi, per cortesia? (21.03.24, 10:59)
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ARGOMENTO:

[Thread Ufficiale] Rosetta@home 19/04/2022 23:37 #137526

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Buonasera, da ormai diverso tempo non sto ricevendo wu da Rosetta.
Siccome non seguo il loro forum (avvio il pc coi miei progetti e spesso non guardo neanche se vanno o meno), mi sapete dire se sono loro ad aver problemi oppure se i problemi sono nel mio pc?
Ho provato a reinstallare Boinc (VirtualBox incluso), a fare il reset del progetto, ad uscire e rientrare, ma il registro eventi continua a segnalare "Scheduler request completed: got 0 new tasks"...

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 21/04/2022 10:13 #137527

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Ho provato a reinstallare Boinc (VirtualBox incluso), a fare il reset del progetto, ad uscire e rientrare, ma il registro eventi continua a segnalare "Scheduler request completed: got 0 new tasks"...


Hai controllato nel tuo profilo utente sul sito se le wus virtualbox sono abilitate per il pc??


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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 06/07/2022 22:43 #137792

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Dopo secoli, ci sono novità scientifiche dal progetto

The IPD is excited to announce it's first designed protein medicine with full approval abroad.
Congrats and thank you to all Rosetta@home contributors! The computing you have provided has greatly aided in de novo protein design challenges such as vaccine development leading to breakthroughs like this.



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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 14/08/2022 17:20 #137837

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Sul forum di Rosetta i volontari stanno testando il nuovo wrapper di Boinc (che se aspettano gli amministratori del progetto, campa cavallo).
Quasi quasi, se funziona, ci faccio una guida all'uopo.


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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 27/08/2022 11:43 #137856

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Ciao, è normale che il fondatore del team su Rosetta non sia più TeamAdmin, ma un certo Marco Chiarini, membro dal 2 maggio 2020?
boinc.bakerlab.org/rosetta/team_display.php?teamid=276

Credo che qualcuno abbia avviato la richiesta di cambio del fondatore del team e abbia avuto successo.
Se ne siete al corrente ed è del tutto normale, passate avanti.
COVID-19

Ringraziano per il messaggio: boboviz

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 30/08/2022 19:39 #137863

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Buonasera,
ho dei problemi con l'esecuzione delle task di python.
Ho scaricato circa una decina di task di rosetta python e tutte mi danno "errore di calcolo".
Ho BOINC e VirtualBox aggiornati, la virtualizzazione è abilitata e ho provato a resettare il progetto ma nulla è cambiato.
Nei log non c’è niente a parte il “task finished”.
Qualcuno ha avuto questo tipo di problema?

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Ultima Modifica: da CryptoBlinx.

[Thread Ufficiale] Rosetta@home 31/08/2022 09:13 #137864

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Buonasera,
ho dei problemi con l'esecuzione delle task di python.
Ho scaricato circa una decina di task di rosetta python e tutte mi danno "errore di calcolo".
Ho BOINC e VirtualBox aggiornati, la virtualizzazione è abilitata e ho provato a resettare il progetto ma nulla è cambiato.
Nei log non c’è niente a parte il “task finished”.
Qualcuno ha avuto questo tipo di problema?


I log di Boinc ti indicano che sia presente la Virtualbox?
All'avvio deve esserci una riga di questo tipo
31/08/2022 08:37:35 |  | VirtualBox version: 6.1.32
Hai controllato la quantità di ram? Le wus di phyton sono ghiotte di memoria....


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Ringraziano per il messaggio: CryptoBlinx

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 31/08/2022 10:19 #137865

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31/08/2022 09:55:51 |  | VirtualBox version: 6.1.36
Per quanto riguarda la RAM ho disponibili 10,5 Gb dopo l'avvio di Windows, bastano?
Nelle preferenze di elaborazione ho controllato la quantità di RAM disponibile che risulta essere 14 Gb in idle.
Le ultime task ricevute ho provato ad eseguirle una alla volta, sospendendo tutte le altre attività e senza altri processi in background, ma continua a dare errore.
Da quello che ho capito (spero di non sbagliarmi) le task di python vengono eseguite su Linux, non è che su VirtualBox devo creare una macchina virtuale Linux?

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 31/08/2022 17:02 #137866

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Da quello che ho capito (spero di non sbagliarmi) le task di python vengono eseguite su Linux, non è che su VirtualBox devo creare una macchina virtuale Linux?

Quando scarichi la prima volta, hai scaricato anche l'hd virtuale di una macchina linux che si avvia in automatico (attraverso il wrapper Vbox) quando parte la wu
A questo punto occorrerebbe vedere i log sul sito di Rosetta e magari aprire lì un thread.
Le tue macchine sono visibili?


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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 31/08/2022 17:03 #137867

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Credo che qualcuno abbia avviato la richiesta di cambio del fondatore del team e abbia avuto successo.
Se ne siete al corrente ed è del tutto normale, passate avanti.


CI stiamo lavorando.


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Ringraziano per il messaggio: Nubman

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 31/08/2022 20:37 #137868

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Cos’è l’hd virtuale?

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 01/09/2022 08:36 #137869

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@CryptoBlinx: hard disk virtuale.

Comunque, partiamo dal log di una tua workunit Python andata in errore.
boinc.bakerlab.org/rosetta/result.php?resultid=1494166678
<core_client_version>7.20.2</core_client_version>
<![CDATA[
<message>
Incorrect function.
 (0x1) - exit code 1 (0x1)</message>
<stderr_txt>
2022-08-30 18:29:32 (7836): Detected: vboxwrapper 26202
2022-08-30 18:29:32 (7836): Detected: BOINC client v7.20.2
2022-08-30 18:29:40 (7836): Error in guest additions for VM: -2147024891
Command:
VBoxManage -q list systemproperties
Output:
VBoxManage.exe: error: Failed to create the VirtualBox object!
VBoxManage.exe: error: The object is not ready
VBoxManage.exe: error: Details: code E_ACCESSDENIED (0x80070005), component VirtualBoxClientWrap, interface IVirtualBoxClient

2022-08-30 18:29:40 (7836): Detected: VirtualBox VboxManage Interface (Version: 6.1.36)
2022-08-30 18:29:47 (7836): Error in host info for VM: -2147024891
Command:
VBoxManage -q list hostinfo 
Output:
VBoxManage.exe: error: Failed to create the VirtualBox object!
VBoxManage.exe: error: The object is not ready
VBoxManage.exe: error: Details: code E_ACCESSDENIED (0x80070005), component VirtualBoxClientWrap, interface IVirtualBoxClient

2022-08-30 18:29:47 (7836): WARNING: Communication with VM Hypervisor failed.
2022-08-30 18:29:47 (7836): ERROR: VBoxManage list hostinfo failed
18:29:47 (7836): called boinc_finish(1)

</stderr_txt>
]]>
Ci sono vari errori su cui lavorare.

Strano anche l'errore che hai avuto su una wu dell'app Rosetta, che neanche usa Virtualbox.
boinc.bakerlab.org/rosetta/result.php?resultid=1494116107
<core_client_version>7.20.2</core_client_version>
<![CDATA[
<message>
The extended attributes are inconsistent.
 (0xff) - exit code 255 (0xff)</message>
<stderr_txt>
command: projects/boinc.bakerlab.org_rosetta/rosetta_4.20_windows_x86_64.exe @rb_08_27_400427_395554_ab_t000__h002_robetta_FLAGS -in::file::fasta t000__h002.fasta -in:file:boinc_wu_zip rb_08_27_400427_395554_ab_t000__h002_robetta.zip -frag3 rb_08_27_400427_395554_ab_t000__h002_robetta.200.3mers.index.gz -fragA rb_08_27_400427_395554_ab_t000__h002_robetta.200.14mers.index.gz -fragB rb_08_27_400427_395554_ab_t000__h002_robetta.200.5mers.index.gz -nstruct 10000 -cpu_run_time 28800 -boinc:max_nstruct 20000 -checkpoint_interval 120 -mute all -database minirosetta_database -in::file::zip minirosetta_database.zip -boinc::watchdog -boinc::cpu_run_timeout 36000 -run::rng mt19937 -constant_seed -jran 1869018
Using database: database_357d5d93529_n_methyl\minirosetta_database

</stderr_txt>
]]>
Questo sembra essere un errore legato a Windows: www.google.com/searc...nded+attributes+are+inconsistent+windows


Ammetto di non sapere che pesci pigliare. :asd:
COVID-19

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 04/09/2022 16:48 #137875

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@boboviz @Nubman Thanks for the help :grazie: ;)
Ho trovato il problema: nel wizard di boinc avevo fleggato l’opzione “service install”, così avevo installato boinc come un programma “daemon” e non aveva sufficienti privilegi per comunicare con Virtual Box.
Dopo averlo reinstallato senza l’opzione “service install”, finalmente le task di python funzionano.
Ringraziano per il messaggio: boboviz, Nubman

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 02/10/2022 11:19 #137910

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Buongiorno, stamani all'avvio del pc mi è uscito il seguente avviso:



E i file interessati sarebbero i seguenti:



Mi devo preoccupare? O si tratterà di un falso allarme? Perchè l'antivirus Bitdefender non mi ha rilevato niente...

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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 02/10/2022 18:22 #137912

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E' il classico falso positivo.
Se vuoi puoi farlo presente nel forum del progetto (anche se non so possa servire a qualcosa)


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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 06/10/2022 10:59 #137921

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Uno degli amministratori del progetto, dopo secoli, si è fatto vivo sul forum e ha detto che l'attuale batch sarà di circa 5 milioni di wus....


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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 26/11/2022 14:04 #137987

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Mi ero perso, a fine settembre, questo messaggio di Kim sul forum sui futuri lavori riguardanti Rosetta@Home

There are plans for more python tasks, but we are still working on creating the new disk image for the VM.
This image will likely be larger in size since we hope to run some of the latest deep-learning based methods for protein design and validation.

Computing resources are still very much in high demand within the Baker Lab and IPD so Rosetta@home will definitely help once we can get the latest software set up and running.

Also, the standard rosetta application is currently being worked on for an update.
The IPD has hired a software developer specifically to help expedite this.

I am not sure about timelines at the moment but hopefully there should be updates to both projects/apps within the next month or so.


Sembra stiano lavorando ad un nuovo applicativo VirtualBox (speriamo usando il nuovo wrapper ufficiale)
Inoltre dovrebbero rilasciare, dopo oltre 2 anni, un applicativo standard aggiornato e che ci sia uno sviluppatore apposito per questo lavoro.
Vediamo cosa vien su....


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Ultima Modifica: da boboviz.

[Thread Ufficiale] Rosetta@home 02/03/2023 15:45 #138115

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Succose novità (chissà se si realizzeranno mail)
In pratica il comitato di RosettaCommons (la base sw di tutti i progetti, come Rosetta@Home, Fold.it, RosettaFold, ecc) ha cominciato, dietro le quinte, un anno fa a discutere della trasformazione della piattaforma in opensource (una piccola parte dei loro sw, come RosettaFold sono già open su github, ma il "core" della piattaforma è ancora chiuso).
La cosa ha portato anche ad una ridiscussione della struttura del comitato, con la creazione di vari sottogruppi di lavoro.

Vediamo cosa ne esce....per maggiori info trovate qui il post


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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 07/04/2023 12:30 #138197

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Ieri è apparso, a sorpresa, un applicativo beta numerato come 6.00 sul server di Rosetta.
Su Ralph stanno sperimentando la versione 4.25.

Numerazioni straordinarie e dove trovarle


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[Thread Ufficiale] Rosetta@home 13/04/2023 16:45 #138212

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Ieri è apparso, a sorpresa, un applicativo beta numerato come 6.00 sul server di Rosetta.

Ne ho prese un paio, vediamo come vanno.
(La grafica, come nelle 4.25 di Ralph, non funziona)


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