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boboviz
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Alcune novità sia per
SCC
che per
MCM
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"We continue to face indifference and resistance from the high-performance computing establishment." D. Anderson
The first italian guy with 1 milion (and half) on Ralph
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boboviz
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Interessanti novità su OpenPandemics:
The researchers have been working on a GPU version of AutoDock, and their initial testing has gone very well. WCG's tech team will now begin their own testing and will provide more information soon. No ETA yet--stay tuned!
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corla99
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Stavo cercando di limitare il numero di wu di Africa Rainfall Project tramite un app_config....ma non ne vuole sapere di andare
Probabilmente sbaglio il nome dell'applicazione, qualcuno sa quale è giusto?
Ps. non credo sia influente, ma sono su linux
<app_config>
<app>
<name>Africa Rainfall Project</name>
<max_concurrent>8</max_concurrent>
</app>
</app_config>
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xdarma
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Referente Climate
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...dove il mondo diventa mancino...
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A me risulta essere "arp1". -----------
project: World Community Grid
application: arp1
platform: x86_64-pc-linux-gnu
version: 7.27
estimated GFLOPS: 5.62
filename: wcgrid_arp1_wrf_7.27_x86_64-pc-linux-gnu
-----------
Ringraziano per il messaggio: corla99
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Ultima Modifica: da xdarma.
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corla99
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Eccolo!
BoincTask mi ha tirato un "brutto scherzo" ingannandomi...
Per il futuro, come faccio a recuperare le info di una wu?
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boboviz
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Il team di OpenPandemics ha pubblicato una interessante pagina dove spiegano quello che stanno facendo e cosa hanno ottenuto in questa parte iniziale del progetto.
OpenPandemics
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boboviz
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E' partita la fase alfa per lo sviluppo del client gpu per OpenPandemics. Speriamo di vedere preso le beta sui nostri pc e poi l'applicativo definitivo del progetto.
Dai, dai.
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Ringraziano per il messaggio: Mpegforever
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corla99
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Piacevole sorpresa con delle wu beta per il sotto progetto SCC (Smash Childhood Cancer)
Un po' di info:
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boboviz
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Piacevole sorpresa con delle wu beta per il sotto progetto SCC (Smash Childhood Cancer)
Le code SCC, adesso, sono belle piene!!
Ah, si è unita un'altra ricercatrice al progetto.
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Il progetto MCM, ad inizio anno, ha cominciato a rilasciare wus riguardanti i sarcomi. In questi mesi sono state analizzate varie sotto-tipologie di questo tumore e adesso stanno per rilasciare la versione beta del nuovo applicativo che andrà ad analizzare le differenze (e le somiglianze) di tutte queste tipologie, per meglio comprendere come si sviluppano e, soprattutto, come curarle.
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Il progetto MCM, ad inizio anno, ha cominciato a rilasciare wus riguardanti i sarcomi. In questi mesi sono state analizzate varie sotto-tipologie di questo tumore e adesso stanno per rilasciare la versione beta del nuovo applicativo che andrà ad analizzare le differenze (e le somiglianze) di tutte queste tipologie, per meglio comprendere come si sviluppano e, soprattutto, come curarle.
Qui l'annuncio
dell'arrivo del nuovo applicativo e di come migliorerà le analisi
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Il progetto Smash Childhood Cancer va in "pausa", ovvero passano a testare i nostri risultati in laboratorio.
Qui l'annuncio
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E' partita la fase alfa per lo sviluppo del client gpu per OpenPandemics. Speriamo di vedere preso le beta sui nostri pc e poi l'applicativo definitivo del progetto.
La strada sembra bella lunga.
Ad inizio di quest'anno i ricercatori del ForliLab (quelli che gestiscono il progetto OpenPandemics) hanno pubblicato un paper riguardante l'ultima versione dell'Autodock (la quattro) e del suo utilizzo in OpenCl.
Hanno detto che stanno lavorando al client per boinc
Speriamo
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Hanno detto che stanno lavorando al client per boinc
Mi ha risposto su Twitter direttamente il responsabile del ForliLab (che è italiano) in maniera esplicita:
Scaldate i motori!
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Altra ottima notizia (sempre da twitter):
but we settled with single because we were getting sufficiently high quality with the gradient descent
In pratica l'applicativo sarà in singola precisione e non in doppia
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Visto come è andata con Folding, poter contare anche sulle gpu darebbe un bel boost alla ricerca.
Nulla da togliere agli altri progetti, ma probabilmente ci saranno un po' di persone che migreranno le loro gpu su WCG. Speriamo non rilascino le wu col contagocce
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boboviz
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Visto come è andata con Folding, poter contare anche sulle gpu darebbe un bel boost alla ricerca.
Dipende sempre da com'è il protocollo e da come viene ottimizzato. Ovviamente le gpu possono dare molto, basta saperle sfruttare.
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Aggiornamento OpenPandemics
Hanno mandato in laboratorio i primi 25 composti promettenti
Buoni progressi anche per il client GPU: dovrebbe mancare davvero poco
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boboviz
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Su Twitter hanno chiesto al responsabile del progetto se si sta lavorando anche alle "varianti" del virus (quella inglese, quella brasiliana, ecc). La risposta è stata questa:
we are preparing the new work units to target the Spike protein (where many relevant mutations in the British variants are) but we are not shipping those packages yet. The ideal goal would be to find molecules working on both the wild-type and the mutants
In pratica stnno lavorando alle nuove wu, ma le devono ancora rilasciare e sperano che i risultati aiutino anche con le varianti.
Le gpu, in questo momento, sarebbero veramente utili!!
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