Superlink@Technion
PARTE 1
Superlink@Technion aiuta i genetisti ad effettuare analisi sul linkage genetico, un metodo statistico utilizzato per associare le funzionalità dei geni alla loro posizione nei cromosomi. Risulta utile per individuare quei geni che mutando provocano delle malattie.
Questa analisi può essere particolarmente intensiva dal punto di vista computazionale e per ovviare a questo problema è stata parallelizzata in modo da poter essere eseguita simultaneamente su più computer (ndr: tale parallelizzazione è il requisito fondamentale per i progetti di calcolo distribuito).
I genetisti sottomettono i dati per le analisi sul portale
Superlink-online
e automaticamente i loro task vengono parallelizzati e programmati per l'esecuzione sia sui PC presenti all'
istituto Technion (israeliano)
e all'università del Wisconsin, sia sui PC dei volontari connessi al progetto via BOINC.
Recentemente hanno condotto delle ricerche sul Parkinson: c'è un interessante articolo che sto' traducendo.
Ho trovato un trafiletto che spiega in parole (credo) semplici cosa si intenda per
linkage genetico:
Il metodo classico dellanalisi statistica finalizzato alla localizzazione cromosomica dei geni coinvolti in un dato carattere è rappresentato dalla cosiddetta analisi di linkage parametrica condotta su una o più famiglie in cui segrega il carattere studiato (fenotipo malattia). Lo scopo e` quello di verificare se il carattere fenotipico viene trasmesso nellambito delle famiglie indipendentemente rispetto a uno (o più) marcatori genomici. Quando esiste una correlazione statisticamente significativa, si dice che è presente linkage genetico tra il gene coinvolto nella determinazione del carattere e il marcatore.
Applicazioni: per tutti gli OS (Win, Linux e MAC) - Manca una applicazione specifica per Windows 64 bit
RAM: una WU può occupare fino a 450 MB
Disponibilità WU: a batch di qualche milione alla volta con pause di durata variabile (settimana/e)