ARGOMENTO:

sabayonino ha scritto:

mi sembra di averne elaborata una per sbaglio qualche giorno fa

beato te (ps. non ti vedo negli utenti Ralph sul sito....è per chiederti l'amicizia)
In 10 giorni hanno fatto girare meno di 200 wu. Niente da dire, un test approfondito.....
Speriamo solo che se lo passano in rosetta non ci siano casini

boboviz ha scritto:

sabayonino ha scritto:

mi sembra di averne elaborata una per sbaglio qualche giorno fa

beato te (ps. non ti vedo negli utenti Ralph sul sito....è per chiederti l'amicizia)
In 10 giorni hanno fatto girare meno di 200 wu. Niente da dire, un test approfondito.....
Speriamo solo che se lo passano in rosetta non ci siano casini

è che non posso creare un profilo (quindi non mi vedi negli utenti del paese)

The requested URL /create_profile.php was not found on this server.

... amicizia ? non sono su FB

ralph.bakerlab.org/t...eamid=560&offset=0&sort_by=expavg_credit

Le prime impressioni sono "entusiastiche".
16 ore su uno Xeon (senza checkpoint), 20 crediti!!!
Niente da dire, proprio un progetto per chi ha voglia di rac.....

E' uscita la versione 3.48 con bugfix e ulteriori miglioramenti del protocollo di simulazione.
Due cose:
1) Speriamo che lo testino a fondo e non le poche decine di wu che passano di solito, per poi trovarsi nei casini quando il tutto va su Rosetta
2) Non ho ben capito questa frase:

This version (as all new versions) is a snapshot of the latest Rosetta software.

speriamo che funzioni bene,e che quindi la possano portare rapidamente in Rosetta (possibilmente prima del nostro challenge)
Chiedo troppo ??

Rosetta ultimamente fa proprio c...re!!
Adesso provo a crunchare su Ralph

boboviz ha scritto:

E' uscita la versione 3.48 con bugfix e ulteriori miglioramenti del protocollo di simulazione.
Due cose:
1) Speriamo che lo testino a fondo e non le poche decine di wu che passano di solito, per poi trovarsi nei casini quando il tutto va su Rosetta
2) Non ho ben capito questa frase:

This version (as all new versions) is a snapshot of the latest Rosetta software.

Questa versione (come tutte quelle nuove) è uno snapshot dell'ultimo software di rosetta.

vuol dire che i fix sono trasmessi anche all'app ufficiale .

poi se erano ubriachi nmon lo so

sabayonino ha scritto:

Questa versione (come tutte quelle nuove) è uno snapshot dell'ultimo software di rosetta.
vuol dire che i fix sono trasmessi anche all'app ufficiale.

Grazie, so anch'io l'inglese
Solo che il concetto di snapshot io l'ho diverso, ovvero un checkpoint per poter "tornare indietro" in caso di casini...

zioriga ha scritto:

Rosetta ultimamente fa proprio c...re!!

?? Ho visto il tuo thread su forum di rosetta....
Hai problemi?

Adesso provo a crunchare su Ralph

In bocca al lupo...c'è una wu ogni far di vescovo

Adesso provo a crunchare su Ralph

boboviz ha scritto:

sabayonino ha scritto:

Questa versione (come tutte quelle nuove) è uno snapshot dell'ultimo software di rosetta.
vuol dire che i fix sono trasmessi anche all'app ufficiale.

Grazie, so anch'io l'inglese
Solo che il concetto di snapshot io l'ho diverso, ovvero un checkpoint per poter "tornare indietro" in caso di casini...

Secondo me si riferiscono al pacchetto Rosetta (non quello portato su boinc). Quindi hanno fatto una "istantanea" allo stato di sviluppo di Rosetta e l'hanno portata su Ralph@home. Se si comporta bene su Ralph la porteranno, immagino, su Rosetta@home.

Per Rosetta infatto credo sia necessario ricordare di tener divisi i due progetti: il pacchetto rosetta commons (www.rosettacommons.org/) utilizzabile così com'è (io l'ho usato per fare protein-protein docking nella mia tesi) e il suo porting su BOINC.

Simone ha scritto:

Secondo me si riferiscono al pacchetto Rosetta (non quello portato su boinc). Quindi hanno fatto una "istantanea" allo stato di sviluppo di Rosetta e l'hanno portata su Ralph@home. Se si comporta bene su Ralph la porteranno, immagino, su Rosetta@home.

Per Rosetta infatto credo sia necessario ricordare di tener divisi i due progetti: il pacchetto rosetta commons (www.rosettacommons.org/) utilizzabile così com'è (io l'ho usato per fare protein-protein docking nella mia tesi) e il suo porting su BOINC.

Ecco, vedi, se ne impara ogni giorno una nuova.
Io pensavo che il percorso fosse il contrario, ovvero che il codice "testato" e usato su Ralph/Rosetta fosse POI portato su Rosettacommons e sui server Robetta.....

boboviz ha scritto:

Simone ha scritto:

Secondo me si riferiscono al pacchetto Rosetta (non quello portato su boinc). Quindi hanno fatto una "istantanea" allo stato di sviluppo di Rosetta e l'hanno portata su Ralph@home. Se si comporta bene su Ralph la porteranno, immagino, su Rosetta@home.

Per Rosetta infatto credo sia necessario ricordare di tener divisi i due progetti: il pacchetto rosetta commons (www.rosettacommons.org/) utilizzabile così com'è (io l'ho usato per fare protein-protein docking nella mia tesi) e il suo porting su BOINC.

Ecco, vedi, se ne impara ogni giorno una nuova.
Io pensavo che il percorso fosse il contrario, ovvero che il codice "testato" e usato su Ralph/Rosetta fosse POI portato su Rosettacommons e sui server Robetta.....

di solito il testing funziona così

bhè, dipende da cosa si considera come la fase di produzione: su rosetta@home producono risultati o fanno solo test? Io credo che il software lo sviluppino per "rosetta commons", e quindi disponibile per robetta o per qualcuno che vuole scaricarselo, e poi lo portano, tramite ralph su rosetta@home per eseguire grosse simulazioni, sia di test per verificare gli algoritmi implementati utilizzando qualche benchmark noto, sia per produrre nuovi risultati.
Però sono tutte mie supposizioni Non so esattamente cosa facciano su rosetta@home

@bobo si che ho problemi
perchè tu non ne hai ??

dopo un po di ricerche ho visto che ultimamente non c'è quasi niente che funziona su rosetta
i messaggi di Boinc mi danno di continuo questa segnalazione

10/6/2013 2:28:28 PM | rosetta@home | Task Ross2X3_SAVE_ALL_OUT_f066_CS_frag_006_97400_90_1 exited with zero status but no 'finished' file
10/6/2013 2:28:28 PM | rosetta@home | If this happens repeatedly you may need to reset the project.
10/6/2013 2:28:28 PM | rosetta@home | Restarting task Ross2X3_SAVE_ALL_OUT_f066_CS_frag_006_97400_90_1 using minirosetta version 346 in slot 0
10/6/2013 2:30:09 PM | rosetta@home | Task rb_09_14_41760_81249_h004__r7_IGNORE_THE_REST_09_10_97507_1_1 exited with zero status but no 'finished' file
10/6/2013 2:30:09 PM | rosetta@home | If this happens repeatedly you may need to reset the project.
10/6/2013 2:30:09 PM | rosetta@home | Restarting task rb_09_14_41760_81249_h004__r7_IGNORE_THE_REST_09_10_97507_1_1 using minirosetta version 346 in slot 36

ma anche un reset, un detach e re-attach non risolvono il problema.
Tra le altre cose quando succede la situazione sopra riportata, l'HD si mette a girare come un pazzo, l'utilizzo del PC si abbassa a livello vicino allo zero (taskmanager) e diventa difficoltoso riuscire a lavorare

Questi sono comportamenti che ho trovato anche su alcuni, se non tutti i sottoprogetti di WCG.

La mia speranza è che fosse solo un problema relativo a un PC, ma in realtà, lo stesso problema è su un XP64b e su un W7 64b

Sull'XP sono anche passato da 8GB di ram a 16 GB ma il problema continua a presentarsi

zioriga ha scritto:

@bobo si che ho problemi
perchè tu non ne hai ??

dopo un po di ricerche ho visto che ultimamente non c'è quasi niente che funziona su rosetta
i messaggi di Boinc mi danno di continuo questa segnalazione

10/6/2013 2:28:28 PM | rosetta@home | Task Ross2X3_SAVE_ALL_OUT_f066_CS_frag_006_97400_90_1 exited with zero status but no 'finished' file
10/6/2013 2:28:28 PM | rosetta@home | If this happens repeatedly you may need to reset the project.
10/6/2013 2:28:28 PM | rosetta@home | Restarting task Ross2X3_SAVE_ALL_OUT_f066_CS_frag_006_97400_90_1 using minirosetta version 346 in slot 0
10/6/2013 2:30:09 PM | rosetta@home | Task rb_09_14_41760_81249_h004__r7_IGNORE_THE_REST_09_10_97507_1_1 exited with zero status but no 'finished' file
10/6/2013 2:30:09 PM | rosetta@home | If this happens repeatedly you may need to reset the project.
10/6/2013 2:30:09 PM | rosetta@home | Restarting task rb_09_14_41760_81249_h004__r7_IGNORE_THE_REST_09_10_97507_1_1 using minirosetta version 346 in slot 36

ma anche un reset, un detach e re-attach non risolvono il problema.
Tra le altre cose quando succede la situazione sopra riportata, l'HD si mette a girare come un pazzo, l'utilizzo del PC si abbassa a livello vicino allo zero (taskmanager) e diventa difficoltoso riuscire a lavorare

Questi sono comportamenti che ho trovato anche su alcuni, se non tutti i sottoprogetti di WCG.

La mia speranza è che fosse solo un problema relativo a un PC, ma in realtà, lo stesso problema è su un XP64b e su un W7 64b

Sull'XP sono anche passato da 8GB di ram a 16 GB ma il problema continua a presentarsi

Quell'errore qua l'ho sempre ignorato e non ho mai avuto problemi di validazione. Ho notato che in genere dopo un po' di tempo si sistema da solo

e invece purtroppo con molta probabilità la WU va in errore.

credo addirittura che ci sia un watchdog che controlla e manda in errore la WU se il fenomemo è troppo frequente o se il numero di ripartenze arriva a un certo valore.

Ho visto da qualche parte sul forum, indicazioni di quel tipo

zioriga ha scritto:

e invece purtroppo con molta probabilità la WU va in errore.

credo addirittura che ci sia un watchdog che controlla e manda in errore la WU se il fenomemo è troppo frequente o se il numero di ripartenze arriva a un certo valore.

Ho visto da qualche parte sul forum, indicazioni di quel tipo

Ma parli solo di RALPH o in generale? Perché su altri progetti non ho mai notato questo comportamento

campos ha scritto:

Adesso provo a crunchare su Ralph

Mai dire mai.
Ho scaricato un po' di lavoro dopo mesi, ovviamente versione 3.46.......

boboviz ha scritto:

Mai dire mai.
Ho scaricato un po' di lavoro dopo mesi, ovviamente versione 3.46.......

Orpo! Che direi...

Ho controllato subito il mio task ed è fermo al 16/7 con tre belle WU subito crashate...

campos ha scritto:

Orpo! Che direi...

Infatti, guarda il mio rac del progetto....bel davvero!!
Il classico progetto pro-RAC