ARGOMENTO:

morse ha scritto:

Simone ha scritto:

Io per il mio lavoro di tesi sto cominciando ad usare rosetta per i conti che devo eseguire. Rosetta non è però un programma, bensì una suite di diverse decine di programmi ognuno dei quali svolgono lavori molto diversi gli uni dagli altri. Vi sono software di protein folding, docking proteina-proteina (quello che uso io), docking proteina-ligando, ottimizzazione di strutture e così via.
Io sto usando l'ultima versione stabile che è la 3.4.
Probabilmente come dice morse diverse persone stanno lavorando su diversi algoritmi. Ciò che mi pare strano è che usino questa numerazione delle versioni un po' strana... potrebbero tutti adottare la 3.4.1 e applicare lì le diverse modifiche.

Mio parere poi potrei benissimo sbagliarmi: potrebbe essere che vogliono confrontare stesse wu con versioni diverse?

Immagino anch'io che siano "controlli incrociati" o diversi filoni di ricerca.
Il fatto è che nessuno del team dice niente....ci siamo lamentati spesso di questo "lack of comunication"

Ultimamente capisco sempre meno il team di Ralph.
Oltre a non farsi sentire da più di 200 giorni (ho capito il lavoro, ma un post almeno ogni 6 mesi non credo sia una cosa impossibile), stanno facendo cose turche.
Dopo la versione 3.42 (che non è mai passata in produzione su rosetta ed è stata pure testata poco su Ralph), hanno fatto uscire la 3.43. Anche di questa un solo batch di poche migliaia di wu e con un bel po' di problemi riportati sul forum.
Cosa fanno? La girano subito in produzione su Rosetta.....
Ed infatti sul forum di rosetta hanno già cominciato a segnalare i primi problemi.

Ma le vogliamo testare o no queste versioni?
Noi di Ralph (e dico noi perché tutti sapete quanto ci tenga a questo progetto, nonostante i pochi crediti)che cosa ci stiamo a fare?? Sfruttateci e fateci sentire che apprezzate la nostra partecipazione e il nostro impegno nel debugging....


Scusate lo sfogo

Hai ragione, sia Ralph che Albert sono stati concepiti appositamente per i test...quindi prima di fare qualcosa che vada in produzione dovrebbero testarlo e ritestarlo fino alla noia...l`importante dopo è che funzioni quasi al 100% sul progetto "madre"...ma a quanto pare non sembra il caso...

boboviz ha scritto:

Ultimamente capisco sempre meno il team di Ralph.
Oltre a non farsi sentire da più di 200 giorni (ho capito il lavoro, ma un post almeno ogni 6 mesi non credo sia una cosa impossibile), stanno facendo cose turche.
Dopo la versione 3.42 (che non è mai passata in produzione su rosetta ed è stata pure testata poco su Ralph), hanno fatto uscire la 3.43. Anche di questa un solo batch di poche migliaia di wu e con un bel po' di problemi riportati sul forum.
Cosa fanno? La girano subito in produzione su Rosetta.....
Ed infatti sul forum di rosetta hanno già cominciato a segnalare i primi problemi.

Ma le vogliamo testare o no queste versioni?
Noi di Ralph (e dico noi perché tutti sapete quanto ci tenga a questo progetto, nonostante i pochi crediti)che cosa ci stiamo a fare?? Sfruttateci e fateci sentire che apprezzate la nostra partecipazione e il nostro impegno nel debugging....


Scusate lo sfogo

Mi sono arrivate delle Ralph 3.43: che ti abbiano sentito?

boboviz ha scritto:

Ultimamente capisco sempre meno il team di Ralph.
Oltre a non farsi sentire da più di 200 giorni (ho capito il lavoro, ma un post almeno ogni 6 mesi non credo sia una cosa impossibile), stanno facendo cose turche.
Dopo la versione 3.42 (che non è mai passata in produzione su rosetta ed è stata pure testata poco su Ralph), hanno fatto uscire la 3.43. Anche di questa un solo batch di poche migliaia di wu e con un bel po' di problemi riportati sul forum.
Cosa fanno? La girano subito in produzione su Rosetta.....
Ed infatti sul forum di rosetta hanno già cominciato a segnalare i primi problemi.

Ma le vogliamo testare o no queste versioni?
Noi di Ralph (e dico noi perché tutti sapete quanto ci tenga a questo progetto, nonostante i pochi crediti)che cosa ci stiamo a fare?? Sfruttateci e fateci sentire che apprezzate la nostra partecipazione e il nostro impegno nel debugging....


Scusate lo sfogo

infatti ho notato che alcune WU (una ventina ?) sono andate in errore ... non ci ho fatto caso più di tanto

[edit]su rosetta@h ... non sono iscritto a RALPH

aridaie
Ancora wu versione 3.43, che parte lo screensaver...
Ma non si parlano tra di loro quelli di rosetta e quelli di ralph? (che poi è lo stesso team)

boboviz ha scritto:

aridaie
Ancora wu versione 3.43, che parte lo screensaver...
Ma non si parlano tra di loro quelli di rosetta e quelli di ralph? (che poi è lo stesso team)

mi sono spaventato quando si sono aperte le finestre dello screensaver


ma ora mi viene il dubbio... ma quelle WU funzionano o vanno abortite?

baxnimis ha scritto:

boboviz ha scritto:

aridaie
Ancora wu versione 3.43, che parte lo screensaver...
Ma non si parlano tra di loro quelli di rosetta e quelli di ralph? (che poi è lo stesso team)

mi sono spaventato quando si sono aperte le finestre dello screensaver


ma ora mi viene il dubbio... ma quelle WU funzionano o vanno abortite?

Io le ho brasate all'istante...

E ho staccato Ralph, fino alla fine del Challenge...

PS su Ubuntu, Ralph senza problemi...

campos ha scritto:

PS su Ubuntu, Ralph senza problemi...

Ovvio, era sbagliato il nome dell'applicativo win 64 bit.
Su xp 32 e su linux non c'erano problemi!

Dopo un bel po' di tempo senza lavoro oggi hanno rilasciato un batch
Ovviamente ancora con il problema dello screensaver
Ma io dico, son passati 2 mesi da quel problema e siamo ancora a quel punto??

boboviz ha scritto:

Dopo un bel po' di tempo senza lavoro oggi hanno rilasciato un batch

qualche WU anche ieri e oggi

su 10 una sola non è andata in errore di calcolo (dopo un'ora e mezza ), ora ne ho ancora 3

baxnimis ha scritto:

qualche WU anche ieri e oggi

su 10 una sola non è andata in errore di calcolo (dopo un'ora e mezza ), ora ne ho ancora 3

A me ne sono andate in errore un paio dopo 4 ore....
Ho postato una serie di log sul loro forum, spero si degnino di guardarli

boboviz ha scritto:

baxnimis ha scritto:

qualche WU anche ieri e oggi

su 10 una sola non è andata in errore di calcolo (dopo un'ora e mezza ), ora ne ho ancora 3

A me ne sono andate in errore un paio dopo 4 ore....
Ho postato una serie di log sul loro forum, spero si degnino di guardarli

sperem...

le 3 sono andate in errore, ho disabilitato la richiesta di WU

ne ho prese un po' su un altro computer, non si sa mai che su Intel vadano meglio

Finalmente un po' di lavoro continuativo e senza tanti crash.....

boboviz ha scritto:

Finalmente un po' di lavoro continuativo e senza tanti crash.....

e infatti adesso son 3 giorni che i server sono giù (pure il sito)
Ho parlato troppo presto....per fortuna avevo riconsegnato tutte le wu

Ancora server giù, anche se il sito va....
Speriamo risolvano questi problemi che periodicamente si ripresentano.

Preso una WU!

Chiaramente in errore dopo 0 secondi...

campos ha scritto:

Preso una WU!

Chiaramente in errore dopo 0 secondi...

Ne ho prese un paio subito in errore (e l'ho segnalato)
Adessso ne ho una decina e sembrano andare....vediamo dopo mesi di run dry del progetto cosa ne esce

Dopo mesi di silenzio, tre giorni fa una luce con la nuova versione (3.47) dell'applicativo:

This update includes various bug fixes, new features related to the use of experimental data, and other code/feature updates made to Rosetta from the RosettaCommons developers/researchers, the most significant is a new and improved score function

Di wu, ovviamente, nemmeno a parlarne....

boboviz ha scritto:

Dopo mesi di silenzio, tre giorni fa una luce con la nuova versione (3.47) dell'applicativo:

This update includes various bug fixes, new features related to the use of experimental data, and other code/feature updates made to Rosetta from the RosettaCommons developers/researchers, the most significant is a new and improved score function

Di wu, ovviamente, nemmeno a parlarne....

mi sembra di averne elaborata una per sbaglio qualche giorno fa