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[Thread Ufficiale] GPUGrid

BOINC Pentathlon 2024

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ARGOMENTO:

[Thread Ufficiale] GPUGrid 02/09/2016 01:21 #122345

sabayonino
Online
Administrator
Gentoo||KDE
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News dal progetto :

Matt sembra esser tornato dalle ferie :run:

e per placare i bollenti spiriti estivi....

ci informa di nuove Beta-WU scritte in python :sbavvv:

(al momento Linux-Only) :ciapet:

(probabilmente sotto l'ombrellone non avevai cruciverba in C++ ma solo quelli in python :sbonk:

)

quello che mi fa sorridere è un paio di post successivi :

"Is there anything in particular we need to have installed on our linux machines? Is python already installed by default in linux distributions?"

Python distributions and packaging are what's technically known as a catastrophe. We have to deploy our own stand-alone environment to have any hope of getting a reliable base to work from.

per i temerari , dalle preferenze del progetto , selezionare :

Quantum Chemistry (Linux, CPU): yes
Python Runtime : yes

anche se non ne vedo di pronte :
www.gpugrid.net/server_status.php

Quantum Chemistry 	0 	0 	0.00 (0.00 - 0.00) 	0
Anaconda Python 3 Environment 	0 	0 	0.00 (0.00 - 0.00) 	0

conda.anaconda.org/omnia
www.continuum.io/anaconda-overview
journals.plos.org/pl...id=10.1371%2Fjournal.pcbi.1004728#sec024 (Availability and Future Directions)
www.ch.cam.ac.uk/com.../anaconda-scientific-python-distribution

in pratica utilizzano "conda" come "alternativa" a virtualbox ... :blink:

o qualcosa del genere

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Ultima Modifica: da sabayonino.

[Thread Ufficiale] GPUGrid 02/09/2016 07:25 #122346

zioriga Online RAM 512 KB Messaggi: 2983 Ringraziamenti ricevuti 254	da quello che ho visto, dopo una rapida scorsa delle pagine, sembrerebbe un ambiente + o - integrato per la gestione ed elaborazione di dati relativi di tipo di simulazione biologica. se così fosse potrebbe essere una buona notizia
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[Thread Ufficiale] GPUGrid 02/09/2016 08:07 #122348

Nubman Offline RAM 512 KB Messaggi: 2304 Ringraziamenti ricevuti 279	Io ho usato Anaconda per la tesi. È un bel mattone pieno zeppo di librerie (soprattutto scientifiche) inutili per l'utente medio. Per esempio ci sono i vari numpy e matplotlib di default. COVID-19
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[Thread Ufficiale] GPUGrid 02/09/2016 12:17 #122350

boboviz Offline Administrator Messaggi: 7953 Ringraziamenti ricevuti 422	Sembra che ci siano anche delle timide aperture verso un applicativo che giri su gpu Amd...... Sei curioso dei risultati scientifici di Boinc? Guarda la sezione Pubblicazioni. "We continue to face indifference and resistance from the high-performance computing establishment." D. Anderson The first italian guy with 1 milion (and half) on Ralph
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[Thread Ufficiale] GPUGrid 02/09/2016 12:40 #122351

sabayonino Online Administrator Gentoo\|\|KDE Messaggi: 5720 Ringraziamenti ricevuti 338	boboviz ha scritto: Sembra che ci siano anche delle timide aperture verso un applicativo che giri su gpu Amd...... ...lo fanno per farvi star buoni un pò... Sostieni BOINC.Italy con una donazione. Folding@Home
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[Thread Ufficiale] GPUGrid 02/09/2016 13:31 #122352

boboviz
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sabayonino ha scritto:

boboviz ha scritto:
Sembra che ci siano anche delle timide aperture verso un applicativo che giri su gpu Amd......

...lo fanno per farvi star buoni un pò...

Sei curioso dei risultati scientifici di Boinc? Guarda la sezione Pubblicazioni.

"We continue to face indifference and resistance from the high-performance computing establishment." D. Anderson

The first italian guy with 1 milion (and half) on Ralph

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[Thread Ufficiale] GPUGrid 03/09/2016 16:04 #122356

xdarma Offline Referente Climate ...dove il mondo diventa mancino... Messaggi: 1047 Ringraziamenti ricevuti 85	sabayonino ha scritto: per i temerari , dalle preferenze del progetto , selezionare : Quantum Chemistry (Linux, CPU): yes Python Runtime : yes Dovrebbe servire anche: Usa la CPU (Si applica dalla versione 6.10+ dei client): si . . . . Chiedi il rimborso del Sistema (In)Operativo! Public money -> Public code
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[Thread Ufficiale] GPUGrid 03/09/2016 19:56 #122358

sabayonino Online Administrator Gentoo\|\|KDE Messaggi: 5720 Ringraziamenti ricevuti 338	xdarma ha scritto: sabayonino ha scritto: per i temerari , dalle preferenze del progetto , selezionare : Quantum Chemistry (Linux, CPU): yes Python Runtime : yes Dovrebbe servire anche: Usa la CPU (Si applica dalla versione 6.10+ dei client): si credo di si . è una opzione che è attiva dal 2010 ... e chi si ricordava Sostieni BOINC.Italy con una donazione. Folding@Home
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[Thread Ufficiale] GPUGrid 05/09/2016 22:15 #122369

boboviz
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sabayonino ha scritto:
credo di si . è una opzione che è attiva dal 2010 ... e chi si ricordava

Per dire quanto viene usata.
A volte credo che gpugrid sia il progetto degli annunci (app per cpu, per android, per opencl) che non si concretizzano.
Vediamo se anche stavolta.....

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Ultima Modifica: da boboviz.

[Thread Ufficiale] GPUGrid 07/09/2016 21:16 #122377

xdarma
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Referente Climate
...dove il mondo diventa mancino...
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boboviz ha scritto:
Per dire quanto viene usata.
A volte credo che gpugrid sia il progetto degli annunci (app per cpu, per android, per opencl) che non si concretizzano.
Vediamo se anche stavolta.....

Mi sa che c'hai ragione tu, speriamo dìano segni di vita.
Comunque ci sarebbe già pronto qualcosa per le gpu radeon:
Continuum Analytics Anaconda® with Numba Acceleration
Addirittura con supporto HSA...
Troppo bello: non succederà. :rotfl:

. .

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[Thread Ufficiale] GPUGrid 08/09/2016 11:46 #122380

boboviz
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xdarma ha scritto:
Mi sa che c'hai ragione tu, speriamo dìano segni di vita.

L'hanno annunciato 8 giorni fa e non si è vista mezza wu.
Almeno aspettate a fare gli annunci in pompa magna :asd:

Comunque ci sarebbe già pronto qualcosa per le gpu radeon:
Addirittura con supporto HSA...
Troppo bello: non succederà.

L'avevo già visto. Oggi ho provveduto a girare il link sul thread di gpugrid :ciapet:

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[Thread Ufficiale] GPUGrid 08/09/2016 16:05 #122386

xdarma
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Referente Climate
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boboviz ha scritto:
L'hanno annunciato 8 giorni fa e non si è vista mezza wu.
Almeno aspettate a fare gli annunci in pompa magna

Peccato perché credo possa essere utile al progetto, nel senso che visto che hanno qualche problema di "failure rate", forse uniformare l'ambiente in cui gira l'applicazione li aiuterebbe nel debug. Spero.

@sabayonino
visto che la potenziale applicazione gira solo su linux, posso spammare suggerendo l'uso di BILD ai non-pinguini volenterosi? Magari dopo che sono state rilasciate un po' di WU e dopo qualche test "casalingo"?

. .

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[Thread Ufficiale] GPUGrid 08/09/2016 19:59 #122388

sabayonino
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xdarma ha scritto:

@sabayonino
visto che la potenziale applicazione gira solo su linux, posso spammare suggerendo l'uso di BILD ai non-pinguini volenterosi? Magari dopo che sono state rilasciate un po' di WU e dopo qualche test "casalingo"?

BILD è sempre lì che aspetta ad esser scaricata (ed utilizzata) ... io la sto testando per vedere l'utilizzo delle VM .. ho inserito una versione di Vbox della quale non so quanto possa esser digerita (nella DEV) :angelo:

(le docker di cosmology non hanno creato problemi)

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Ultima Modifica: da sabayonino.

[Thread Ufficiale] GPUGrid 19/09/2016 17:59 #122411

boboviz Offline Administrator Messaggi: 7953 Ringraziamenti ricevuti 422	Come volevasi dimostrare: 20 giorni e nemmeno una wu. Classico paper launch di gpugrid. Sei curioso dei risultati scientifici di Boinc? Guarda la sezione Pubblicazioni. "We continue to face indifference and resistance from the high-performance computing establishment." D. Anderson The first italian guy with 1 milion (and half) on Ralph
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[Thread Ufficiale] GPUGrid 19/09/2016 18:58 #122413

sabayonino Online Administrator Gentoo\|\|KDE Messaggi: 5720 Ringraziamenti ricevuti 338	boboviz ha scritto: Come volevasi dimostrare: 20 giorni e nemmeno una wu. Classico paper launch di gpugrid. sono a secco anche le WU GPU se è per quello... Sostieni BOINC.Italy con una donazione. Folding@Home
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[Thread Ufficiale] GPUGrid 06/10/2016 16:19 #122597

zioriga Online RAM 512 KB Messaggi: 2983 Ringraziamenti ricevuti 254	A proposito del supporto delle schede NVIdia Pascal www.gpugrid.net/forum_thread.php?id=4341#44627 They are working with CUDA8.0 driver, however on Windows systems it seems to be slower than the latest CUDA7.5 driver (359.06). Andiamo bene !!!! Stanno aspettando la release CUDA 8.5. Speriamo in bene !!!
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[Thread Ufficiale] GPUGrid 14/10/2016 09:03 #122685

zioriga
Online
RAM 512 KB
Messaggi: 2983
Ringraziamenti ricevuti 254

questa news farà contento il bobo
www.gpugrid.net/forum_thread.php?id=4395

Message 44670 - Posted: 13 Oct 2016 | 14:54:07 UTC
Hey all. The next weeks I will be sending out some simulations starting with the CASP name. It will consist of a total of 3600 simulations running at any time (meaning that once some of them complete, new ones are sent to reach again 3600) probably for a month or so.
It will probably be my most thorough and organized method test so far so it should be fun

The simulations have their length written in their name (1ns, 5ns, 20ns and 50ns). Some will end up in the short queue and some in the long queue. Longest simulation time I measured on a 780 was 8 hours for one of the proteins at 50ns and shortest at 0.1 hour.

Right now I sent out the first protein called NTL9 to test if everything works as expected (so no 3600 simulations yet) but the next week I will probably send out another 4 proteins. So there should be lots to crunch in the coming days

Adesso si mettono a generare WU CASP- ma sembra sia difficilissimo riuscire a prenderne

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[Thread Ufficiale] GPUGrid 14/10/2016 10:37 #122686

boboviz
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Administrator
Messaggi: 7953
Ringraziamenti ricevuti 422

zioriga ha scritto:
Adesso si mettono a generare WU CASP- ma sembra sia difficilissimo riuscire a prenderne

Dal momento che il CASP è finito a metà Agosto ho idea che non abbia niente a che fare con quell'evento.

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[Thread Ufficiale] GPUGrid 28/10/2016 08:14 #122788

zioriga Online RAM 512 KB Messaggi: 2983 Ringraziamenti ricevuti 254	è uscita la versione di test per le WU short (per le schede Pascal) dopo alcuni errori e riaggiustamenti sembra funzionare (le short sembrerebbero durare solo 5-10 min ma sarà meglio aspettare il batch definitivo e non quello di test) www.gpugrid.net/forum_thread.php?id=4405#44966 vedremo per le long
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[Thread Ufficiale] GPUGrid 28/10/2016 18:07 #122799

Gattorantolo Offline RAM >4 GB Mosconi for President Messaggi: 6223 Ringraziamenti ricevuti 63	zioriga ha scritto: è uscita la versione di test per le WU short (per le schede Pascal) dopo alcuni errori e riaggiustamenti sembra funzionare (le short sembrerebbero durare solo 5-10 min ma sarà meglio aspettare il batch definitivo e non quello di test) www.gpugrid.net/forum_thread.php?id=4405#44966 vedremo per le long Le schede Pascal.... ???
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