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ARGOMENTO: [Thread Ufficiale] XAnsons4cod

[Thread Ufficiale] XAnsons4cod 16/11/2016 14:33 #123066

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Descrzione

XANSONS for COD è un progetto di ricerca volto a creare un database ad accesso aperto di modelli simulati di diffrazione di raggi X e polvere di neutroni per la fase nanocristallina dei materiali presentati nel Database aperto di cristallo (COD) .

I calcoli per questo progetto sono stati completati. Il database dei modelli simulati di diffrazione della polvere è disponibile all'indirizzo database.xansons4cod.com .

Questo progetto utilizza il software open source originale (licenza GPLv3) XaNSoNS (Scattering di raggi X e neutroni su strutture nanoscale) per simulare i modelli di diffrazione su CPU e GPU.

XANSONS per COD è un progetto BOINC gestito privatamente. È stato supportato dalla Fondazione russa per la ricerca di base nel 2015-2017 (progetto RFBR n. 15-07-07901-a).


E' nato, ma in fase alpha, questo progetto xansons4cod.com/xansons4cod/

Sulla home page ci sono abbondati spiegazioni sulle finalità (analisi cristallografica XRay e diffusione neutronica a livello di scala nanometrica. (confesso di averci capito poco, ma dai paroloni riportati, sembra una cosa interessante.

Ci sono però al, momento attuale, un paio di cosette:

This project is on alpha stage and under heavy developement. It will be re-launched when ready (approximately at the end of 2017). All the results obtained before the re-launch will likely be lost.

pertanto il partecipare è a rischio

Il progetto è gestito privatamente con il supporto della

Russian Foundation for Basic Research


C'è il supporto a WIn, Linux, Mac oltre che alle sk grafiche NVidia e AMD ed esiste applicativo mt.

Direi siano partiti alla grande !!!!
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Nuovo progetto XAnsons 16/11/2016 16:32 #123069

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Nuovo progetto XAnsons 16/11/2016 17:28 #123070

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MOLTO interessante.
La cristallografia a raggi X è un metodo di analisi usatissimo in tanti campi, dallo studio dei nuovi materiali al ripiegamento proteico (è la tecnica usata per verificare se una predizione proteica è valida non solo in silico ma anche in vitro).
Vediamo cosa ne esce.....


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Nuovo progetto XAnsons 16/11/2016 17:29 #123071

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zioriga ha scritto:
C'è il supporto a WIn, Linux, Max oltre che alle sk grafiche NVidia e AMD ed esiste applicativo mt.

Direi siano partiti alla grande !!!!

....intendi Mac?
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Nuovo progetto XAnsons 16/11/2016 18:19 #123072

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Si adesso correggo.
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Nuovo progetto XAnsons 16/11/2016 21:34 #123074

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Fatti alcuni test veloci.
- il client cpu occupa, ovviamente, tutti i core e finisce in circa 3 minuti
- il client gpu carica ben bene la scheda ma ha una durata veramente variabile, dai 4 secondi ai 2 minuti. Lo segnalo sul forum...
- da 1,1 a 30 crediti a wu (dipendendo, ovviamente, dalla durata).

Vediamo come si sviluppa stò progetto


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Nuovo progetto XAnsons 16/11/2016 21:38 #123075

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l'indirizzo IP punta ad una "macchina" Amazon EC2
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Nuovo progetto XAnsons 16/11/2016 21:54 #123076

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boboviz ha scritto: Fatti alcuni test veloci.
- il client cpu occupa, ovviamente, tutti i core e finisce in circa 3 minuti
- il client gpu carica ben bene la scheda ma ha una durata veramente variabile, dai 4 secondi ai 2 minuti. Lo segnalo sul forum...
- da 1,1 a 30 crediti a wu (dipendendo, ovviamente, dalla durata).

Vediamo come si sviluppa stò progetto


dalla Homepage

Supported GPUs:

  • Nvidia GPU with CUDA Compute Capability 1.3 and above (Windows, Linux) or 2.0 and above (OS X/macOS) with at least 1GB of memory (GDDR5 memory is recommended). Driver version 340.21 and above (Windows, Linux) or CUDA Driver for MAC version 7.0.29 and above (OS X/macOS).
  • AMD GPU with OpenCL 1.2+ support with at least 1GB of memory (GDDR5 memory is recommended). Some issues with integrated AMD GPUs have been reported. It is not recommended to use them for this project until these issues are resolved.
  • Intel GPU with OpenCL 1.2+ support (HD graphics 5xxx/5xx and above or Intel Iris are highly recommended, see Important Notes below).

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Nuovo progetto XAnsons 17/11/2016 07:55 #123080

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sabayonino ha scritto: dalla Homepage

Supported GPUs:

  • Nvidia GPU with CUDA Compute Capability 1.3 and above (Windows, Linux) or 2.0 and above (OS X/macOS) with at least 1GB of memory (GDDR5 memory is recommended). Driver version 340.21 and above (Windows, Linux) or CUDA Driver for MAC version 7.0.29 and above (OS X/macOS).
  • AMD GPU with OpenCL 1.2+ support with at least 1GB of memory (GDDR5 memory is recommended). Some issues with integrated AMD GPUs have been reported. It is not recommended to use them for this project until these issues are resolved.
  • Intel GPU with OpenCL 1.2+ support (HD graphics 5xxx/5xx and above or Intel Iris are highly recommended, see Important Notes below).


?? Avevo già letto le note....
E comunque oggi hanno pubblicato una piccola tabella con le percentuali dei vari applicativi. Su gpu (sia cuds che opencl) siamo intorno al 99% di risultati positivi. Non male considerando che è un progetto beta senza tanti test precedenti....


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Nuovo progetto XAnsons 19/11/2016 13:27 #123103

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Buongiorno a tutti B.I
Qulcuno di voi già partecipa a questo progetto?
I crediti accumulati si vanno a sommmare a quelli degli altri progetti sulle statistiche di Boincstats? perchè sono andato a controllare su Boincstats ma non ho visto la voce relativa a questo progetto.

Inoltre dite sia rischioso partecipare per quale motivo? si rischia che il progetto venga chiuso in tempoi brevi?
Grazie mille
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Nuovo progetto XAnsons 19/11/2016 14:27 #123104

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Qualcuno ha già partecipato, come ha scritto qualcuno su questo thrread.

Evidentemente BOINC.Stats non ha ancora "agganciato" questo progetto, o forse questo progetto non rilascia i files xml necessari, non ho ancora controllato.

Se hai letto bene il primo posto che ho messo, dovresti aver visto che i crediti su questo progetto potrebbero essere persi quando si passerà alla fase operativa (prevista per fine 2017).

Puoi benissimo partecipare, ma, con quello detto sopra, lo fai a tuo rischio (nel senso che potrai, forse, perdere i crediti)

Lo scopo di una partecipazione a livello di singolo, ha un senso, in questa fase, solo per aiutare a mettere a punto il programma.
Ultima modifica: da zioriga.
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Nuovo progetto XAnsons 19/11/2016 20:36 #123109

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Grazie mille zioriga per la risposta!
Credo che aspetterò prima di attaccarmi a questo progetto allora.
:bye:
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Nuovo progetto XAnsons 25/11/2016 10:54 #123210

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Alcune novità:
- Hanno aggiornato i client Windows e Linux per Cuda e Opencl. Adesso le wu sono decisamente più "sostanziose" e durano circa 4 minuti su una 260x
- Il progetto, via server, riserva un core cpu per le wu gpu. Non c'è bisogno di file xml sul client....
E poi:

Server will be upgraded to Amazon c4.large instance this Saturday. The upgrade should be easy but who knows what can go wrong. When the server will be upgraded, the number of new WUs generated per hour will be increased 5-10 times. The final stage of alpha-testing will last for 2-3 days. Then the project will be suspended for long-term maintenance which will take a few months.

During the maintenance:
- The periodic boundary conditions will be implemented in XaNSoNS to get rid of the divergence of the diffraction pattern at low scattering angles.
- The native BOINC apps will be created (the current apps use the BOINC wrapper).
- The data calculated so far will be analyzed for possible errors and inconsistencies.
- The infrastructure of the database of the diffraction patterns will be created.



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Nuovo progetto XAnsons 30/11/2016 08:20 #123303

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Sul sito è apparsa una descrizione sugli aspetti scientifici ("powder diffraction") di questo progetto, con una lunga serie di rimandi ad altri siti, per maggiori approfondimenti. Per chi ha voglia, ha da divertirsi ad approfondire questo progetto.

Inoltre c'è un lunga news di cui provo a riassumere gli aspetti più significativi:
1. hanno stoppato la generazione di nuove WU, rimangono in attesa di ricevere quelle attualmente in giro.
2. hanno stoppato l'iscrizione di nuovi utenti.
3. in questa prima fase sono riusciti a ridurre il tasso di errore a meno dell'1%
4. hanno adottato dimensioni differenti delle WU in funzione degli applicativi a cui saranno sottoposti (+ piccoli per le WU di sola CPU, medi per CPU mt e + grandi per GPU) . Credo sia il primo caso in cui ciò avviene.
5. il prossimo step dovrebbe partire intorno a primavera del prossimo anno.


Detto tutto questo, mi sembra sempre più interessante questo progetto. Ce ne fossero di progetti gestiti così bene !!!!
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Nuovo progetto XAnsons 01/12/2016 11:56 #123316

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zioriga ha scritto: Detto tutto questo, mi sembra sempre più interessante questo progetto. Ce ne fossero di progetti gestiti così bene !!!!


Speriamo non sia un fuoco di paglia.
Nonostante fosse un progetto addirittura in alfa (a maggio comincerà la fase beta) è andato veramente bene.
Visto che l'app gpu era un wrapper, aspetto di vedere cosa farà l'applicazione nativa che hanno intenzione di creare!!!


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Nuovo progetto XAnsons 02/01/2017 19:35 #123763

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boboviz ha scritto: Speriamo non sia un fuoco di paglia.


Sembrerebbe di no.
Al team si è aggiunto Nikolay Khrapov (amministratore di Sat@Home) per aiutarli sia nello sviluppo del codice che nell'amministrazione del server (di cui ha esperienza, ovviamente).


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Nuovo progetto XAnsons 08/02/2017 10:29 #124056

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Il team, nonostante il progetto sia in fase di stallo, ha pubblicato un paper in cui ringrazia anche tutti i volontari di Boinc che hanno partecipato a questa fase alfa, aiutando gli amministratori nel debug del codice.

Se continuano di questo passo mi sà che ci tocca fare il thread. la scheda progetto e il team ufficiali...


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Nuovo progetto XAnsons 08/02/2017 22:11 #124060

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boboviz ha scritto: Il team, nonostante il progetto sia in fase di stallo, ha pubblicato un paper in cui ringrazia anche tutti i volontari di Boinc che hanno partecipato a questa fase alfa, aiutando gli amministratori nel debug del codice.

Se continuano di questo passo mi sà che ci tocca fare il thread. la scheda progetto e il team ufficiali...


:pauraeh: metti in ordine le priorità: team ( statistiche ), poi thread e infine scheda progetto :bua:
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Nuovo progetto XAnsons 19/04/2017 18:35 #124760

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Il lavoro è fermo da tempo, ma almeno gli amministratori bazzicano il forum per rispondere agli utenti, tipo riguardo le tempistiche per nuovo lavoro....

I hope, we will restart the calculations in two months.



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Nuovo progetto XAnsons 19/04/2017 19:42 #124763

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boboviz ha scritto: Il lavoro è fermo da tempo, ma almeno gli amministratori bazzicano il forum per rispondere agli utenti, tipo riguardo le tempistiche per nuovo lavoro....

I hope, we will restart the calculations in two months.


Ci vuole fegato anche per esserci e rispondere.
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