ARGOMENTO:

Dragen

Dragen è la prima scheda FPGA espressamente dedicata all'NGS (Next Generation Sequencing), con risultati incredibili:

DRAGEN mapping against the ash tree genome was 177 times faster per processing core than TGAC’s local HPC systems, requiring only seven minutes instead of three hours on one of the larger datasets. Alignment runs on the rice genome that take approximately two hours on TGAC’s HPC servers took just three minutes using DRAGEN

Proprio vero che l'hw dedicato è il meglio!

boboviz ha scritto:

Dragen

Dragen è la prima scheda FPGA espressamente dedicata all'NGS (Next Generation Sequencing), con risultati incredibili:

DRAGEN mapping against the ash tree genome was 177 times faster per processing core than TGAC’s local HPC systems, requiring only seven minutes instead of three hours on one of the larger datasets. Alignment runs on the rice genome that take approximately two hours on TGAC’s HPC servers took just three minutes using DRAGEN

Proprio vero che l'hw dedicato è il meglio!

anche l'hardware nostrano è ...dedicato

boboviz ha scritto:

Dragen

Dragen è la prima scheda FPGA espressamente dedicata all'NGS (Next Generation Sequencing), con risultati incredibili:

DRAGEN mapping against the ash tree genome was 177 times faster per processing core than TGAC’s local HPC systems, requiring only seven minutes instead of three hours on one of the larger datasets. Alignment runs on the rice genome that take approximately two hours on TGAC’s HPC servers took just three minutes using DRAGEN

Proprio vero che l'hw dedicato è il meglio!

Quanto costa fabbricarlo? In quanto si rompe? Quanto consuma?

Ma soprattutto si può comprare?

Nubman ha scritto:

Ma soprattutto si può comprare?

Sicuramente non dal negozio di computer sottocasa.
Da quello che ho capito leggendo, per adesso è necessario comprare dei server "ad hoc" per farla girare, ma hanno già pensato alla versione che funzionerebbe anche con server Xeon/Opteron standard