ARGOMENTO:

Il fatto e' che mi sembra che non esista una proporzionalita' diretta tra # di sequenze e # di WU, poi quando capita che mettono in elaborazione WU provenienti da piu' di un database, non puoi prevedere dal batchmonitor cosa saltera' fuori.

astroale ha scritto:

Il fatto e' che mi sembra che non esista una proporzionalita' diretta tra # di sequenze e # di WU, poi quando capita che mettono in elaborazione WU provenienti da piu' di un database, non puoi prevedere dal batchmonitor cosa saltera' fuori.

Sicuramente non è diretta la proporzionalità però, in generale, più sequenze hanno, più wu è facile che ci siano.
Purtroppo dal batchmonitor non puoi prevedere cosa verrà fuori perché, se non mi ricordo male, hanno dei problemi di spazio sul server e le wu le devono distribuire gradatamente

della TOP HOST sul progetto

che soddisfazione

baxnimis ha scritto:

della TOP HOST sul progetto

che soddisfazione

Ma cos'hai un PC o un "Bidone Aspiratutto?"

Comunque grande BAX!

baxnimis ha scritto:

della TOP HOST sul progetto

che soddisfazione

Complimenti Bax!!!

SIMAP su un linux a 64 bit sembra attestarsi su 7 Mb di RAM.

OS: Fedora 12
Kernel: 2.6.32.14.fc12.x86_64
BOINC Manager: 6.10.45

simap _5.10_x86_64-pc-linux-gnu 6,8-7,8 Mb


Ringrazio anticipatamente chi aggiornerà la pagina dei consumi della RAM

gian82 ha scritto:

Ringrazio anticipatamente chi aggiornerà la pagina dei consumi della RAM

Direi che la nostra pagina e' oramai obsoleta e inutile da quando e' partito il progetto WUprop , siete d'accordo ?
Ti consiglio di farne l'attach cosi' potrai contribuire automaticamente ... anche se sono temporaneamente fermi.


Per rimanere in topic ... ho notato casualmente (non controllo mai) che un certo numero di WU del SIMAP mi vanno in errore con questo messaggio:

<error_code>-131</error_code>

Ne sapete nulla ? Capita anche a voi ?

Da notare che non lo fa' su un unico PC ma su quasi tutti quelli che impiego:

boinc.bio.wzw.tum.de...tid=158542&offset=0&show_names=0&state=5

boinc.bio.wzw.tum.de...tid=159361&offset=0&show_names=0&state=5

boinc.bio.wzw.tum.de...tid=150407&offset=0&show_names=0&state=5

boinc.bio.wzw.tum.de...tid=158800&offset=0&show_names=0&state=5

boinc.bio.wzw.tum.de...tid=166025&offset=0&show_names=0&state=5

boinc.bio.wzw.tum.de...tid=158053&offset=0&show_names=0&state=5

Cmq la percentuale di WU errorate non sembra allarmante, ma sapevo che il SIMAP era uno dei progetti piu' affidabili da questo punto di vista ... strano.

astroale ha scritto:

..Cmq la percentuale di WU errorate non sembra allarmante, ma sapevo che il SIMAP era uno dei progetti piu' affidabili da questo punto di vista ... strano.

stesso errore anche a me, specialmente negli ultimi 2 giorni, ma i crediti vengono comunque concessi

Anche a me da qualche errore ogni tanto, ma poche sul totale

Guardando il batchmonitor vedo che hanno fatto un salto verso le WU "from public databases" lasciando ferme a 7/10 quelle "from metagenomes". Significa che vogliono elaborare prima quelle agosto e finire dopo quelle di luglio ? o mi sono perso qualcosa ? ... cmq non capitava da tempo + di un mese di elaborazione continua ...

Effettivamente, guardando il batchmonitor, sembra che abbiano messo avanti quelle di agosto e fermate quelle di luglio!

news dal progetto:

The current workunits calculate the similarities and domains of approx. 310,000 new sequences from public databases and approx. 5 million new environmental sequences imported in July 2010. After these calculations are finished, next workunits are expected on September 1st.

Niente piu' breakpoint su (alcune) WU del SIMAP ???

Uno zottone alla 220 ha resettato dei criceti e ho notato che alcuni sono ripartiti dallo 0% anche se mantengono il CPU time vecchio !!!
Non che voglia che vi suicidate i criceti, ma al prossimo reboot del vostro PC potete darci un'occhio ?

astroale ha scritto:

Niente piu' breakpoint su (alcune) WU del SIMAP ???

ho avuto un paio di black-out ma non mi sono soffermato sul comportamento delle WU... la prossima volta ci do una occhiata

astroale ha scritto:

Niente piu' breakpoint su (alcune) WU del SIMAP ???

Uno zottone alla 220 ha resettato dei criceti e ho notato che alcuni sono ripartiti dallo 0% anche se mantengono il CPU time vecchio !!!
Non che voglia che vi suicidate i criceti, ma al prossimo reboot del vostro PC potete darci un'occhio ?

Ho acceso il mio Quad, che fa generalmente orario serale/notturno e ho una WU Simap da 18 minuti che frulla allegramente e non è ripartita da 0%...

ocio qui , WU probabile in esaurimento, direi ancora un giorno o due ... quasi due mesi di elaborazione continua, miii incredibbile!

astroale ha scritto:

ocio qui , WU probabile in esaurimento, direi ancora un giorno o due ... quasi due mesi di elaborazione continua, miii incredibbile!

tanto ne arrivano altre ai primi di settembre

un po' spero che non ce ne siano un'altra volta così tante, ho fatto indigestione

Già, sta quasi diventando un progetto continuo...

Ed io per colpa delle vacanze mi sono perso almeno 7 giorni

E' comparso un altro batch di wu quindi avanti con i

News del 18/8/2010

New workunits approx. until end of August
Since today afternoon we are distributing the last series of workunits containing new environmental sequences from CAMERA metagenomes. Probably these will need until the end of August to be calculated, so we will just continue after them with the regular workunits of September.