ARGOMENTO:

Manuel, come ho scritto nel post precedente, quando puoi inserisci nel portale un contenuto con i dettagli della conferenza che la pubblichiamo

Ciao,
GHz

GHz ha scritto:

Manuel, come ho scritto nel post precedente, quando puoi inserisci nel portale un contenuto con i dettagli della conferenza che la pubblichiamo

Ciao,
GHz

Ah saperli i dettagli... Vedrò di scrivere qualcosa!

7D9 ha scritto:

Ah saperli i dettagli... Vedrò di scrivere qualcosa!

bè, giusto per pubblicare l'avviso

al limite inventati qualcosa

Ho scritto due righe ed un'immagine che fa pietà.
Vi prego di accontentarvi. Non ho tanto tempo per fare di meglio.. GHz, se vuoi modificare qualcosa hai carta bianca.
Chiedo scusa.

7D9 ha scritto:

Ho scritto due righe ed un'immagine che fa pietà.
Vi prego di accontentarvi. Non ho tanto tempo per fare di meglio.. GHz, se vuoi modificare qualcosa hai carta bianca.
Chiedo scusa.

questa è ancora peggio ma non mi veniva niente

7D9 ha scritto:

Ho scritto due righe ed un'immagine che fa pietà.
Vi prego di accontentarvi. Non ho tanto tempo per fare di meglio.. GHz, se vuoi modificare qualcosa hai carta bianca.
Chiedo scusa.

Dove posso vedere ciò che hai fatto?

piero2nd ha scritto:

Dove posso vedere ciò che hai fatto?

noi comuni mortali non possiamo
non abbiamo i poteri

Ducati 749 ha scritto:

piero2nd ha scritto:

Dove posso vedere ciò che hai fatto?

noi comuni mortali non possiamo
non abbiamo i poteri

Non è giusto.

baxnimis ha scritto:

questa è ancora peggio ma non mi veniva niente

E' bello.. io non sarei neanche in grado di farlo!

7D9 ha scritto:

Ho scritto due righe ed un'immagine che fa pietà.
Vi prego di accontentarvi. Non ho tanto tempo per fare di meglio.. GHz, se vuoi modificare qualcosa hai carta bianca.
Chiedo scusa.

Ok, appena ho un attimo libero lo controllo e poi lo pubblico!

Ciao
GHz

Ragazzi, non c'è qualche anima buona che mi fa una ricerca degli articoli pubblicati da Rosetta o inerenti a lavori svolti usando Rosetta? Ci sarebbe da guardare sul sito di BOINC, su quello del lab di Baker e sulla discussione "David Baker journal".

E' una cosa che può servire anche poi per inserirla nei contenuti del portale.

7D9 ha scritto:

Ragazzi, non c'è qualche anima buona che mi fa una ricerca degli articoli pubblicati da Rosetta o inerenti a lavori svolti usando Rosetta? Ci sarebbe da guardare sul sito di BOINC, su quello del lab di Baker e sulla discussione "David Baker journal".

E' una cosa che può servire anche poi per inserirla nei contenuti del portale.

mi ci metto

Sono andato indietro solo fino al 2006

Dal sito Rosetta@home

News & Articles about Rosetta@home.
Xboxic - Apr 2007 - Cure HIV with your 360?
Nature - Ott 2007 - The shape of protein structures to come a pagamento
Seattle Times - Mag 2006 - UW boimedical research taps home computers for oomph

News & Articles about Rosetta.
HHMI News - Mar 2008 - Building Enzymes from Scratch
Technology Review - Mar 2008 - Enzymes Built from Scratch
EurekAlert - Ott 2007 - New approach builds better proteins inside a computer
The Scientist - Lug 2006 Proteins by Design (pdf)

Dal David Baker's journal

Il CASP8
Risultati - Dic 2008

Altro
SeedMagazine.com - Mag 2009 - Designing novel proteins from scratch
Wired.com - Apr 2009 - Gamers Unravel the Secret Life of Protein

Dei 7 manoscritti annunciati non vedo nessuna versione pubblicata

Dal sito di BOINC
Wikipedia - Dic 2008 - Rosetta@home articolo del giorno


Poi ci sono risultati di Rosetta@home che si trovano su questa pagina del sito. Li elenco:

1. Qian B, Raman S, Das R, Bradley P, McCoy AJ, Read RJ, Baker D. High-resolution structure prediction and the crystallographic phase problem, Nature 450, 259-64 (2007).
2. Wang C, Bradley P, Baker D. Protein-protein docking with backbone flexibility. J. Mol. Biol. 373, 503-19 (2007).
3. Misura KM, Chivian D, Rohl CA, Kim DE, Baker D. Physically realistic homology models built with ROSETTA can be more accurate than their templates. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103, 5361-6 (2006).
4. Rhiju Das, Madhuri Kudaravalli, Magdalena Jonikas, Alain Laederach, Robert Fong, Jason P. Schwans, David Baker, Joseph A. Piccirilli, Russ B. Altman, and Daniel Herschlag, Structural inference of native and partially folded RNA by high throughput contact mapping, PNAS, in press (2008).
5. Das R, Qian B, Raman S, Vernon R, Thompson J, Bradley P, Khare S, Tyka MD, Bhat D, Chivian D, Kim DE, Sheffler WH, Malmström L, Wollacott AM, Wang C, Andre I, Baker D. Structure prediction for CASP7 targets using extensive all-atom refinement with Rosetta@home. Proteins 69 Suppl 8, 118-28 (2007).
6. Das R, Baker D. Automated de novo prediction of native-like RNA tertiary structures. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104, 14664-9 (2007).

Ma Bax, non puoi fare sempre tutto tu! Grazie mille!

I 7 articoli preannunciati li sto aspettando anche io. Se nei prossimi giorni non dicono ancora niente scriverò sul loro forum.

7D9 ha scritto:

Ragazzi, non c'è qualche anima buona che mi fa una ricerca degli articoli pubblicati da Rosetta o inerenti a lavori svolti usando Rosetta? Ci sarebbe da guardare sul sito di BOINC, su quello del lab di Baker e sulla discussione "David Baker journal".

E' una cosa che può servire anche poi per inserirla nei contenuti del portale.

qui ci sono tutti gli articoli del gruppo Baker
depts.washington.edu/bakerpg/publications.html

Qui invece, se il link a ScienceDirect funziona, ci sono un po' di articoli nei quali c'è la parola "Rosetta", che purtroppo non appartiene solo a DBaker. Ho cercato di escludere gli altri selezionando solo Giornali inerenti alla materia, ma in mezzo ci sarà comunque finito qualcosa di astronomia che non ha nulla a che vedere con questo.

edit: il link a sciencedirect ho visto che funziona, ma purtroppo non contiene i filtri che avevo messo. Quindi è infarcito di un sacco di articoli legati ad operazioni spaziali

Grazie cenit, quando avrò tempo metterò una lista degli articoli qui sul portale così che possano sempre essere facilmente reperibili da tutti.

Oggi ho conosciuto il Rettore del collegio ed è d'accordo sul riprendere la conferenza.

Perfetto!

P.S. Se mi mandi il tuo indirizzo via e-mail provo a spedirti delle spillette (scrivimi quante ne vuoi, indicativamente fino a una decina massimo)

Allora, tutto pronto per la conferenza?

In bocca al lupo!! Registrate tutto mi raccomando!!!

Ciao,
GHz

Spero siano arrivate le spillette altrimenti ho speso i soldi della spedizione per niente

Attendiamo news!

Ho una cattiva notizia da darvi. Non abbiamo ripreso la presentazione. Mi dispiace, ma non è dipeso da me. Mi era stato detto fino all'ultimo momento che la telecamera ci sarebbe stata e poi oggi pomeriggio vengo invece a sapere che di riprendere la conferenza non se ne fa niente. Non so che farci......
L'altra notizia non troppo buona è che il pubblico era composto da sole 10 persone. Quello che però mi ha colpito positivamente è che su 10, 4 ragazzi si sono dimostrati veramente interessati e hanno chiesto chiarimenti e fatto domande alla fine.
La presentazione nel suo complesso non è stata niente di eccezionale (per questo secondo me non dovreste rammaricarvi troppo della mancanza della ripresa), la parte più corposa era la mia. In ogni caso se lo scopo era di mettere la pulce nell'orecchio a un po' di persone e mostrare una realtà interessante che non conoscevano, direi che siamo riusciti nel nostro intento.

Altra cosa di cui sono soddisfatto è che una dottoranda amica di Federica si è mostrata interessata (al di fuori della conferenza a cui non ha potuto essere presente) alle simulazioni che fa Rosetta e potrebbe in futuro usare il server Robetta per alcuni sui studi.

P.S. spillette trovate nella buca questa sera. Ne lascerò comunque alcune agli interessati e le altre le porterò a Bologna.