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morse ha scritto:
Simone ha scritto:
Io per il mio lavoro di tesi sto cominciando ad usare rosetta per i conti che devo eseguire. Rosetta non è però un programma, bensì una suite di diverse decine di programmi ognuno dei quali svolgono lavori molto diversi gli uni dagli altri. Vi sono software di protein folding, docking proteina-proteina (quello che uso io), docking proteina-ligando, ottimizzazione di strutture e così via.
Io sto usando l'ultima versione stabile che è la 3.4.
Probabilmente come dice morse diverse persone stanno lavorando su diversi algoritmi. Ciò che mi pare strano è che usino questa numerazione delle versioni un po' strana... potrebbero tutti adottare la 3.4.1 e applicare lì le diverse modifiche.
Mio parere poi potrei benissimo sbagliarmi: potrebbe essere che vogliono confrontare stesse wu con versioni diverse?
Immagino anch'io che siano "controlli incrociati" o diversi filoni di ricerca.
Il fatto è che nessuno del team dice niente....ci siamo lamentati spesso di questo "lack of comunication"
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Ultimamente capisco sempre meno il team di Ralph.
Oltre a non farsi sentire da più di 200 giorni (ho capito il lavoro, ma un post almeno ogni 6 mesi non credo sia una cosa impossibile), stanno facendo cose turche.
Dopo la versione 3.42 (che non è mai passata in produzione su rosetta ed è stata pure testata poco su Ralph), hanno fatto uscire la 3.43. Anche di questa un solo batch di poche migliaia di wu e con un bel po' di problemi riportati sul forum.
Cosa fanno? La girano subito in produzione su Rosetta.....
Ed infatti sul forum di rosetta hanno già cominciato a segnalare i primi problemi.
Ma le vogliamo testare o no queste versioni?
Noi di Ralph (e dico noi perché tutti sapete quanto ci tenga a questo progetto, nonostante i pochi crediti)che cosa ci stiamo a fare?? Sfruttateci e fateci sentire che apprezzate la nostra partecipazione e il nostro impegno nel debugging....
Scusate lo sfogo
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Hai ragione, sia Ralph che Albert sono stati concepiti appositamente per i test...quindi prima di fare qualcosa che vada in produzione dovrebbero testarlo e ritestarlo fino alla noia...l`importante dopo è che funzioni quasi al 100% sul progetto "madre"...ma a quanto pare non sembra il caso...
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Ultima Modifica: da Gattorantolo.
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boboviz ha scritto:
Ultimamente capisco sempre meno il team di Ralph.
Oltre a non farsi sentire da più di 200 giorni (ho capito il lavoro, ma un post almeno ogni 6 mesi non credo sia una cosa impossibile), stanno facendo cose turche.
Dopo la versione 3.42 (che non è mai passata in produzione su rosetta ed è stata pure testata poco su Ralph), hanno fatto uscire la 3.43. Anche di questa un solo batch di poche migliaia di wu e con un bel po' di problemi riportati sul forum.
Cosa fanno? La girano subito in produzione su Rosetta.....
Ed infatti sul forum di rosetta hanno già cominciato a segnalare i primi problemi.
Ma le vogliamo testare o no queste versioni?
Noi di Ralph (e dico noi perché tutti sapete quanto ci tenga a questo progetto, nonostante i pochi crediti)che cosa ci stiamo a fare?? Sfruttateci e fateci sentire che apprezzate la nostra partecipazione e il nostro impegno nel debugging....
Scusate lo sfogo
Mi sono arrivate delle Ralph 3.43: che ti abbiano sentito?
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boboviz ha scritto:
Ultimamente capisco sempre meno il team di Ralph.
Oltre a non farsi sentire da più di 200 giorni (ho capito il lavoro, ma un post almeno ogni 6 mesi non credo sia una cosa impossibile), stanno facendo cose turche.
Dopo la versione 3.42 (che non è mai passata in produzione su rosetta ed è stata pure testata poco su Ralph), hanno fatto uscire la 3.43. Anche di questa un solo batch di poche migliaia di wu e con un bel po' di problemi riportati sul forum.
Cosa fanno? La girano subito in produzione su Rosetta.....
Ed infatti sul forum di rosetta hanno già cominciato a segnalare i primi problemi.
Ma le vogliamo testare o no queste versioni?
Noi di Ralph (e dico noi perché tutti sapete quanto ci tenga a questo progetto, nonostante i pochi crediti)che cosa ci stiamo a fare?? Sfruttateci e fateci sentire che apprezzate la nostra partecipazione e il nostro impegno nel debugging....
Scusate lo sfogo
infatti ho notato che alcune WU (una ventina ?) sono andate in errore ... non ci ho fatto caso più di tanto
[edit]su rosetta@h ... non sono iscritto a RALPH
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Ultima Modifica: da sabayonino.
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boboviz
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aridaie
Ancora wu versione 3.43, che parte lo screensaver...
Ma non si parlano tra di loro quelli di rosetta e quelli di ralph? (che poi è lo stesso team)
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boboviz ha scritto:
aridaie
Ancora wu versione 3.43, che parte lo screensaver...
Ma non si parlano tra di loro quelli di rosetta e quelli di ralph? (che poi è lo stesso team)
mi sono spaventato quando si sono aperte le finestre dello screensaver
ma ora mi viene il dubbio... ma quelle WU funzionano o vanno abortite?
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Ultima Modifica: da baxnimis.
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baxnimis ha scritto:
boboviz ha scritto:
aridaie
Ancora wu versione 3.43, che parte lo screensaver...
Ma non si parlano tra di loro quelli di rosetta e quelli di ralph? (che poi è lo stesso team)
mi sono spaventato quando si sono aperte le finestre dello screensaver
ma ora mi viene il dubbio... ma quelle WU funzionano o vanno abortite?
Io le ho brasate all'istante...
E ho staccato Ralph, fino alla fine del Challenge...
PS su Ubuntu, Ralph senza problemi...
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campos ha scritto:
PS su Ubuntu, Ralph senza problemi...
Ovvio, era sbagliato il nome dell'applicativo win 64 bit.
Su xp 32 e su linux non c'erano problemi!
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Dopo un bel po' di tempo senza lavoro oggi hanno rilasciato un batch
Ovviamente ancora con il problema dello screensaver
Ma io dico, son passati 2 mesi da quel problema e siamo ancora a quel punto??
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boboviz ha scritto:
Dopo un bel po' di tempo senza lavoro oggi hanno rilasciato un batch
qualche WU anche ieri e oggi
su 10 una sola non è andata in errore di calcolo (dopo un'ora e mezza ), ora ne ho ancora 3
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baxnimis ha scritto:
qualche WU anche ieri e oggi
su 10 una sola non è andata in errore di calcolo (dopo un'ora e mezza ), ora ne ho ancora 3
A me ne sono andate in errore un paio dopo 4 ore....
Ho postato una serie di log sul loro forum, spero si degnino di guardarli
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boboviz ha scritto:
baxnimis ha scritto:
qualche WU anche ieri e oggi
su 10 una sola non è andata in errore di calcolo (dopo un'ora e mezza ), ora ne ho ancora 3
A me ne sono andate in errore un paio dopo 4 ore....
Ho postato una serie di log sul loro forum, spero si degnino di guardarli
sperem...
le 3 sono andate in errore, ho disabilitato la richiesta di WU
ne ho prese un po' su un altro computer, non si sa mai che su Intel vadano meglio
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Finalmente un po' di lavoro continuativo e senza tanti crash.....
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boboviz ha scritto:
Finalmente un po' di lavoro continuativo e senza tanti crash.....
e infatti adesso son 3 giorni che i server sono giù (pure il sito)
Ho parlato troppo presto....per fortuna avevo riconsegnato tutte le wu
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Ancora server giù, anche se il sito va....
Speriamo risolvano questi problemi che periodicamente si ripresentano.
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Preso una WU!
Chiaramente in errore dopo 0 secondi...
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campos ha scritto:
Preso una WU!
Chiaramente in errore dopo 0 secondi...
Ne ho prese un paio subito in errore (e l'ho segnalato)
Adessso ne ho una decina e sembrano andare....vediamo dopo mesi di run dry del progetto cosa ne esce
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Dopo mesi di silenzio, tre giorni fa una luce con la nuova versione (3.47) dell'applicativo:
This update includes various bug fixes, new features related to the use of experimental data, and other code/feature updates made to Rosetta from the RosettaCommons developers/researchers, the most significant is a new and improved score function
Di wu, ovviamente, nemmeno a parlarne....
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boboviz ha scritto:
Dopo mesi di silenzio, tre giorni fa una luce con la nuova versione (3.47) dell'applicativo:
This update includes various bug fixes, new features related to the use of experimental data, and other code/feature updates made to Rosetta from the RosettaCommons developers/researchers, the most significant is a new and improved score function
Di wu, ovviamente, nemmeno a parlarne....
mi sembra di averne elaborata una per sbaglio qualche giorno fa
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