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Gli amministratori di Denis hanno lanciato, in questi giorni, il sottoprogetto "Replica", il cui compito principale sarà replicare, nelle simulazioni, le ricerche e gli esperimenti già validati nella letteratura scientifica. Paragonare le simulazioni a ricerche reali aiuterà i ricercatori di Denis a migliorare ulteriormente le simulazioni del progetto. In tal senso è stata rilasciata ieri una nuova versione dell'applicativo, la "DENIS Project that replicate the calculus made in Literature and fill the Markers Database".

Qui maggiori informazioni

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Questo è un post triste: alcuni giorni fa è passata a miglior vita Anna Tramontano, pioniera della biologia computazionale in Italia e una delle fondatrici e amministratrici della competizione internazionale CASP.

Ho avuto l'occasione di scambiare un paio di mail con lei alcuni anni fa e, nonostante non necessitasse dell'infrastuttura boinc, fu molto gentile e disponibile.

Ovviamente non esiste una pagina di Wiki in italiano a lei dedicata, ma almeno è presente quella in inglese.

Anche sul sito del CASP la ricordano.

La terra ti sia lieve.

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Gli amministratori di Yoyo assegneranno punteggio doppio alle wu P2 di ECM, dal momento che occupano circa 10gb di ram all'una.

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Il team di Rosetta ha annunciato una nuova pubblicazione sulla rivista Science riguardante una metodologia per la previsione delle proteine attraverso la metagenomica. Con questa metodologia sono riusciti a predire in maniera accurata ben 622 famiglie di proteine non ancora rappresentate nel database internazionale PDB (Protein Database Bank) e circa 100 di queste sono assolutamente nuovi ripiegamenti mai visti. I ricercatori ringraziano tutti i volontari per il costante contributo computazionale al progetto.

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Non sazi della recente pubblicazione, quelli di Foldit hanno deciso di rilasciare a breve un aggiornamento molto importante, il "Blueprint Tool".
Per capire cos'è hanno pubblicato un video di spiegazione che vale più di mille parole, qui

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Gli amministratori di Denis@Home hanno rilasciato un nuovo applicativo che sarà usato per popolare il database che sarà usato dai ricercatori.

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Gli amministratori di Foldit hanno pubblicato su Nature i risultati di una competizione tra esperti di cristallografi, studenti neolaureati, un programma automatico e i semplici volontari di Foldit, risultando questi ultimi i vincitori. Qui il link alla pubblicazione.

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Written on 17/05/2017, 20:41 by boboviz
le-novità-di-foldit-2Questa è la seconda parte dell’articolo in cui abbiamo discusso dei recenti miglioramenti della qualità delle catene primarie Proteine ripiegateQui sotto...

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Written on 17/05/2017, 20:34 by boboviz
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