DNA@home - BOINC.Italy

AMBITO: Biologia, Medicina

STATO: NON ATTIVO da Marzo 2012

ATTACH: http://dnahome.cs.rpi.edu/dna/

VOTO: ( 6 )

L'obiettivo di DNA@Home è scoprire ciò che regola i geni nel DNA. Avete mai notato che le cellule della pelle sono diverse ad esempio dalle cellule muscolari o dalle cellule ossee, sebbene ogni cellula del vostro corpo ha in se tutti i geni del suo DNA? Questo accade perché non tutti i geni sono "attivi" tutto il tempo. A seconda del tipo di cellula e quello che la cellula sta cercando di fare in un certo momento, solo un sottoinsieme dei geni vengono utilizzati mentre il resto è "spento".

DNA@home sfrutta algoritmi statistici per cercare la chiave che regola questo differente comportamento dei geni, utilizzando il lavoro dei computer dei volontari.

Per ulteriori informazioni visitate il thread ufficiale presente nel nostro forum.

Introduzione:

Il metodo principale attraverso il quale sono regolati i geni è nella fase di "trascrizione" in cui una molecola chiamata polimerasi legge il DNA a partire dall'inizio del gene fino alla fine creando una molecola di RNA messaggero. Altre molecole, chiamate "fattori di trascrizione", si legano al DNA vicino all'inizio del gene e possono aiutare le polimerasi a lavorare oppure possono ottenere lo scopo inverso inibendole. È la presenza o l'assenza di questi fattori di trascrizione che determina se un gene è "on" o "off". Il problema è che gli scienziati non sanno ancora quali fattori di trascrizione sono responsabili del regolamento di quali geni.

DNA_legami

I fattori di trascrizione, per legarsi al DNA, utilizzano delle specie di "tentacoli" che preferiscono legarsi a determinate brevi sequenze di nucleotidi, ma in molti casi noi non sappiamo quale sia questa sequenza. Il nostro software cerca le brevi sequenze dei nucleotidi che appaiono più o meno le stesse vicino agli inizi di diversi geni e che compaiono anche più o meno nella stessa posizione nei genomi di specie affini. Siccome però le sequenze di DNA sono enormi (vanno da milioni a miliardi di nucleotidi) e queste sequenze sono brevi e conservate solo approssimativamente da un sito all'altro, il nostro problema è veramente paragonabile al famoso "ago nel pagliaio" e richiede molta potenza di calcolo.

I nostri piani attuali consistono nell'affrontare il genoma del Mycobacterium tuberculosis per comprendere a fondo come la tubercolosi svolge la sua azione, in modo che altri possano utilizzare tali informazioni per fermare questa malattia che uccide milioni di persone ogni anno. Abbiamo anche in programma di affrontare la Yersinia pestis, la causa della peste bubbonica.

Stato del progetto: progetto attivo

Iscrizione libera.

Requisiti minimi: nessuno

Gli sviluppatori non segnalano requisiti minimi da rispettare.

Screensaver: non disponibile

Assegnazione crediti: fissati per singola WU

Quorum = 1 (se è >1 le WU dovranno essere convalidate confrontando i risultati con quelli di altri utenti).

Applicazioni e WU disponibili: vedi scheda "Link"

Cliccare sulle icone relative alle "Applicazioni"

e allo "Stato del server"

Sistemi operativi supportati: vedi scheda "Info tecniche"

Dati specifici sull'elaborazione: vedi scheda "Info tecniche"

Per ottenere dati sulla durata media dell'elaborazione, la RAM necessaria e la dead line, consultare la scheda "Info tecniche" qui a destra. Per informazioni particolareggiate (specifiche per applicazione e sistema operativo, intervallo di backup e crediti assegnati) rifarsi alla pagina dei risultati del progetto WUprop@home.

Problemi comuni: nessuno

Non si riscontrano problemi significativi.

Supporto al progetto: supportato

Per unirsi al team BOINC.Italy consultare la scheda "Link" qui a destra cliccando sull'icona relativa al "JOIN"