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AMBITO: Biologia e medicina
STATO: ATTIVO
ATTACH: http://boinc.bio.wzw.tum.de/boincsimap/
Introduzione
Lo scopo del progetto è quello di creare un database pubblico di somiglianze proteiche. Il confronto fra sequenze proteiche è infatti il più potente strumento della biologia computazionale per caratterizzare una proteina. I domini proteici si sono spesso mantenuti quasi invariati durante l'evoluzione. Scoprire che una proteina X ha una sequenza simile ad un'altra di cui si conosce già la funzione ci può dare indicazioni sulla funzione della proteina in esame.
Il database SIMAP contiene circa tutte le sequenze proteiche attualmente pubblicate ed è continuamente aggiornato. Però ogni giorno vengono sequenziate nuove proteine e lo sforzo computazionale per tenere SIMAP aggiornato cresce costantemente. Elaborando i dati di SIMAP sui nostri PC permettiamo il suo costante aggiornamento.
SIMAP è un progetto congiunto tra il GSF National Research Center for Environment and Health, Neuherberg and Technical University Munich, Center of Life and Food Science Weihenstephan (entrambi in Germania).
Per ulteriori informazioni su SIMAP, continuate a leggere questo articolo e consultate il thread ufficiale sul forum.
VALUTAZIONE DEL PROGETTO: Progetto consigliato
Valutazione complessiva = 66 %
Commento: Il progetto è gestito molto bene, tutte le news sono sia in inglese che in tedesco e gli admin sono presenti quando gli vengono poste delle domande o dei problemi.I risultati sono riportati su database consultabili da qualunque persona o ente che ne sia interessato.
Riguardo alle WU, la deadline è abbastanza lunga (7 giorni), i client sono quasi per tutte le piattaforme (escluso le GPU), sono stabili (non è segnalato nessun problema in particolare) e i checkpoint funzionano correttamente.
Purtroppo, per la natura del progetto, il lavoro non è molto e, quel poco, viene distribuito all'inizio di ogni mese e solo per alcuni giorni (dai 3 ai 7 giorni massimo)
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ELABORAZIONE
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| DeadLine = 7 giorni | |
VALUTAZIONE
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| [0] su (2) Client open-source | | [0] su (2) WU sempre disponibili | | [2] su (2) WU stabili e con checkpoint | | [1] su (1) Down del progetto poco frequenti | | [1] su (2) Applicazioni multi-piattaforma | | [1] su (1) Quorum = Replicazione iniziale | | [1] su (1) Deadline abbastanza lunga | | [3] su (3) Gestito da un ente pubblico | | [0] su (3) Pubblicazioni su riviste scientifiche | | [2] su (2) Risultati pubblici | | [2] su (2) Informazioni chiare sul progetto | | [1] su (1) Admin presenti sul forum | | [1] su (1) News regolari | | [1] su (1) Sito almeno in inglese | | --------------------------------------------------- | | [66%] Qualità complessiva |
NEWS
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22/07/2010
Durante i lavori in svolgimento attorno alla sede del progetto, è stato tranciato il cavo principale, causando un black-out di alcune ore. Ora è tutto tornato alla normalità. | 02/07/2010
A partire dalla serata di ieri, giovedì 1 luglio, sono disponibili circa 170.000 WU. Al termine di questo batch, le prossime WU sono attese intorno al 1° agosto. | 31/05/2010
Le circa 200.000 nuove WU di SIMAP saranno disponibili a partire dalla serata di domani, martedì 1 giugno. | 02/05/2010
La sessione di calcolo di questo mese prevede circa 250.000 nuove sequenze da comparare. | 30/03/2010
Domani inizierà la distribuzione delle WU di SIMAP per il mese di Aprile |
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