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valterc uhmmm le workunit ATM: Free energy calculations of protein-ligand binding vanno anche su Windows (22.03.24, 16:17)
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zioriga la risposta è semplice, attualmente le Wu per GPU sono solo per LInux (21.03.24, 11:39)
samu986 Buongiorno a tutti, sapete per caso se GPUGRID funziona bene? A me interessano le WU per GPU, infatti ho selezionato solo quelle, ma non mi arriva niente da mesi. Qualcuno potrebbe aiutarmi, per cortesia? (21.03.24, 10:59)
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Applicativo multicore Atlas 13/07/2016 18:31 #122064

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Applicativo multicore Atlas 13/07/2016 18:35 #122065

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La formula per sapere l'uso della ram è questa
Total_Memory=1300MB+1000MB*Number_of_CPU_Cores

Quindi un 4 core userà 1,3+4= 5,3 Gb di ram

Dal thread di discussione stanno emergendo alcune cose:
- usare 8 core non è vantaggioso, in termini di tempo, rispetto ad un 4 core. Potrebbe essere un problema di virtualbox o del kernel della vm.
- sembra usi un pò più di ram rispetto alla formula proposta dagli amministratori.

Vabbè è una beta, vediamo come evolve.


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Ultima Modifica: da boboviz.

Applicativo multicore Atlas 13/07/2016 18:40 #122066

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The new tasks going into the multi-core app are much larger than the regular ATLAS tasks. Instead of simulating 25 events they do 200 events so run 8 times longer. This should make the multi-core tasks more efficient by reducing the fraction of time spent on initialisation. If you run an 8 CPU task it should take roughly the same wall time as a regular single core ATLAS task but use 8 times more CPU time - and get 8 times the credit of course.


:sbav:


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Applicativo multicore Atlas 13/07/2016 19:37 #122068

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è un "perotto" (x8) insomma :D

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Applicativo multicore Atlas 14/07/2016 22:50 #122072

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Interessante, dovrei provarlo... che sia meno esoso di risorse di rete?

Se avanza ram, ce lo metto in ramdisk. :asd:
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Applicativo multicore Atlas 21/07/2016 22:23 #122103

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Come già detto, proprio in questi giorni sto facendo girare l'app multicore. Intanto c'è da dire che il primo giorno ha dato problemi (usava soltanto 1-2 thread), ma pare che fosse un problema della loro versione. Con la v1.03 è stato tutto risolto.

Sto facendo girare 1 wu atlas multicore (da 6 thread) + 2 wu vlhc, con la directory 'slots' in ramdisk. Più o meno se ne vanno 15-16gb di ram.
Dal punto di vista del download il tutto è molto interessante. Dopo i primi 20 minuti (che possono anche essere meno a seconda della connessione) di quiete l'app inizia a girare e si prende egregiamente i suoi thread. L'utilizzo non è sempre al 600% (su un totale di 800%), ma più realisticamente oscilla tra 460% e 540%. È quando la wu multicore finisce che son dolori. :asd: Bombe di 170-190mb da uppare. :maroni: E non sto usando nemmeno tutti e 8 i thread! :arg:
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