Pagina 3 di 5
Cos'è il folding e perché è importante - Folding@home
Indice articoli
BOINC.Italy
La community italiana dedicata al calcolo distribuito
Il problema delle enormi capacità di calcolo necessarie è stato risolto da Vijay Pande della Stanford University con il suo progetto Folding@home.
Si parla in questo caso di calcolo distribuito perché piuttosto che far girare il progetto su giganteschi supercomputer, le simulazioni vengono divise in piccoli pezzi (noti come Unità di lavoro, o WU) che vengono inviati via internet ai PC sui quali gira il software F@H. Su questi PC il lavoro viene svolto a seconda dei casi dalla CPU o dalla GPU e poi rimandato al server centrale.
I risultati vengono verificati e se corretti vengono accreditati un certo numero di punti che servono a dare un’idea del lavoro svolto per il progetto. Contemporaneamente al PC ospite vengono inviate nuove unità di lavoro e così via.
Contrariamente a quanto farebbe una società farmaceutica privata, una volta che siano state ricevute abbastanza WU per completare il lavoro, Stanford pubblica i suoi risultati sul suo sito web e sulle riviste mediche.
Si parla in questo caso di calcolo distribuito perché piuttosto che far girare il progetto su giganteschi supercomputer, le simulazioni vengono divise in piccoli pezzi (noti come Unità di lavoro, o WU) che vengono inviati via internet ai PC sui quali gira il software F@H. Su questi PC il lavoro viene svolto a seconda dei casi dalla CPU o dalla GPU e poi rimandato al server centrale.
I risultati vengono verificati e se corretti vengono accreditati un certo numero di punti che servono a dare un’idea del lavoro svolto per il progetto. Contemporaneamente al PC ospite vengono inviate nuove unità di lavoro e così via.
Contrariamente a quanto farebbe una società farmaceutica privata, una volta che siano state ricevute abbastanza WU per completare il lavoro, Stanford pubblica i suoi risultati sul suo sito web e sulle riviste mediche.
Quanto conta una singola Unità di lavoro per Folding@home? In generale si potrebbe dire che una WU simula un milionesimo del processo di ripiegamento proteico. Le proteine non si ripiegano tutte alla stessa velocità; il processo avviene nell’ordine dei micro o dei millisecondi.
Una singola Unità di lavoro riesce a simulare un tempo compreso tra il nano e il microsecondo anche se c’è da dire che le recenti GPU riescono a simulare addirittura l’intero processo di ripiegamento se le proteine sono sufficientemente piccole.
Una singola Unità di lavoro riesce a simulare un tempo compreso tra il nano e il microsecondo anche se c’è da dire che le recenti GPU riescono a simulare addirittura l’intero processo di ripiegamento se le proteine sono sufficientemente piccole.
Discuti questo articolo
Accedi per commentare